172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1456 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1456  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  170  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  87.69 
 
 		 238 aa  127  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  87.69 
 
 		 238 aa  127  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  87.69 
 
 		 238 aa  127  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  84.62 
 
 		 238 aa  124  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  77.42 
 
 		 231 aa  112  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  77.42 
 
 		 232 aa  110  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  77.42 
 
 		 231 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0252  transposase  70.37 
 
 		 73 aa  82  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000199442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  55 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  53.33 
 
 		 233 aa  63.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  51.67 
 
 		 243 aa  63.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  51.67 
 
 		 238 aa  63.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  53.62 
 
 		 232 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  55 
 
 		 180 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  48.44 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  48.44 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  48.44 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  48.44 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  48.44 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  48.44 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  48.44 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  51.67 
 
 		 238 aa  62  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  51.67 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  53.33 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  51.67 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  48.21 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8072  transposase  50 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  56.86 
 
 		 236 aa  60.8  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  56.86 
 
 		 236 aa  60.8  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  56.86 
 
 		 236 aa  60.8  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  51.67 
 
 		 233 aa  60.1  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  51.67 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  51.67 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  51.67 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  50.88 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  56.14 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  50.88 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  50.88 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  50.88 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  50.88 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  50.88 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  55.17 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5571  putative transposase  50.77 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  52.63 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1447  transposase  59.57 
 
 		 52 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149783  normal  0.684371 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  50 
 
 		 237 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7541  transposase  53.45 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  56.25 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  58.82 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  52.63 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  51.72 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  52.63 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  52.63 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  52.08 
 
 		 233 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  52.08 
 
 		 233 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  52.08 
 
 		 233 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  52.08 
 
 		 233 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  52.08 
 
 		 233 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8615  putative transposase  45 
 
 		 233 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  60.87 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  42.03 
 
 		 224 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0249  IS431mec-like transposase  38.18 
 
 		 224 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  38.18 
 
 		 224 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  48.98 
 
 		 251 aa  50.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  38.18 
 
 		 224 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  38.18 
 
 		 224 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  38.18 
 
 		 224 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1015  transposase  42.37 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.653024  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  38.18 
 
 		 224 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  38.18 
 
 		 224 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  38.18 
 
 		 224 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  38.18 
 
 		 224 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  36.36 
 
 		 214 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2740  integrase catalytic subunit  38.18 
 
 		 224 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2817  integrase catalytic region  38.18 
 
 		 224 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264347  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  38.18 
 
 		 226 aa  50.4  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2739  integrase catalytic subunit  38.18 
 
 		 221 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2815  integrase catalytic region  38.18 
 
 		 221 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.411277  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  31.82 
 
 		 235 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  56.52 
 
 		 213 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  48.78 
 
 		 226 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  40.82 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  42.86 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0020  IS431mec-like transposase  36.36 
 
 		 224 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1579  IS431mec-like transposase  36.36 
 
 		 224 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  38.78 
 
 		 226 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  38.78 
 
 		 226 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  38.78 
 
 		 226 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  38.78 
 
 		 226 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  38.78 
 
 		 226 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  38.78 
 
 		 226 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  38.78 
 
 		 226 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  38.78 
 
 		 226 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  35.29 
 
 		 236 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  38.78 
 
 		 226 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  37.29 
 
 		 250 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  37.29 
 
 		 250 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  36.73 
 
 		 226 aa  47.8  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  35.85 
 
 		 235 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>