53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0056 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0056  ImpA domain-containing protein  100 
 
 
480 aa  935  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3721  ImpA domain-containing protein  41.6 
 
 
482 aa  333  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0018  hypothetical protein  32.61 
 
 
469 aa  253  4e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1208  ImpA domain-containing protein  29.26 
 
 
469 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413651  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2517  type VI secretion-associated protein  32.32 
 
 
467 aa  233  8e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29627  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1082  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  34.79 
 
 
475 aa  223  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.424761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3243  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  33.85 
 
 
474 aa  214  3e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2795  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  34.81 
 
 
479 aa  213  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0227  ImpA domain-containing protein  33.68 
 
 
470 aa  210  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0229  ImpA domain-containing protein  35.07 
 
 
470 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.865531  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0235  ImpA domain protein  33.82 
 
 
470 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1219  ImpA domain-containing protein  32.92 
 
 
470 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.192362 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0398  type VI secretion-associated protein  31.77 
 
 
462 aa  198  2e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0325  ImpA domain-containing protein  31.77 
 
 
462 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4072  hypothetical protein  32.69 
 
 
488 aa  197  5e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00713132  unclonable  1.01691e-06 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1100  type VI secretion-associated protein, family  32.11 
 
 
470 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3222  type VI secretion-associated protein  32.08 
 
 
487 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2626  hypothetical protein  32.48 
 
 
487 aa  191  3e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0739443  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2129  ImpA domain-containing protein  32.69 
 
 
487 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  26.79 
 
 
522 aa  147  4e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  31.11 
 
 
520 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  31.78 
 
 
518 aa  140  5e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  25.49 
 
 
533 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  28.84 
 
 
520 aa  133  7e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  28.81 
 
 
518 aa  133  7e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  31.57 
 
 
518 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1125  putative type VI secretion protein VasJ  23.52 
 
 
513 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  29.52 
 
 
789 aa  114  4e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  27.8 
 
 
790 aa  99.8  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  29.81 
 
 
527 aa  79.7  9e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  26.69 
 
 
524 aa  73.2  1e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  37.58 
 
 
598 aa  67  7e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  34.93 
 
 
627 aa  64.3  4e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  24.48 
 
 
530 aa  63.9  6e-09  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  34.93 
 
 
623 aa  63.9  6e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  34.13 
 
 
635 aa  63.5  7e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  26.72 
 
 
523 aa  60.5  7e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  33.97 
 
 
642 aa  59.3  1e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  26.94 
 
 
533 aa  59.3  1e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  31.25 
 
 
638 aa  59.7  1e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  33.97 
 
 
630 aa  59.3  1e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  31.25 
 
 
653 aa  59.7  1e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1180  putative nucleobase:cation symporter  19.78 
 
 
426 aa  58.5  2e-07  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  26.94 
 
 
533 aa  58.9  2e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  8.13522e-06 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  26.94 
 
 
533 aa  59.3  2e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  25.52 
 
 
528 aa  56.6  1e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  26.64 
 
 
534 aa  53.5  9e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  30.97 
 
 
354 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1471  ImpA domain-containing protein  24.46 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1359  ImpA domain-containing protein  24.46 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.906132  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2699  ImpA domain-containing protein  24.46 
 
 
393 aa  45.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.325925  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0162  ImpA domain-containing protein  30.65 
 
 
498 aa  43.9  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  29.2 
 
 
356 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>