21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1180 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1180  putative nucleobase:cation symporter  100 
 
 		 426 aa  849    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0018  hypothetical protein  22.74 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3721  ImpA domain-containing protein  21.39 
 
 		 482 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0056  ImpA domain-containing protein  19.78 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1208  ImpA domain-containing protein  21.35 
 
 		 469 aa  59.7  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2626  hypothetical protein  19.09 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0739443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2129  ImpA domain-containing protein  19.09 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1219  ImpA domain-containing protein  18.4 
 
 		 470 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.192362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1100  type VI secretion-associated protein, family  19.21 
 
 		 470 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1082  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  18.18 
 
 		 475 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.424761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3243  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  20.38 
 
 		 474 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0227  ImpA domain-containing protein  17.42 
 
 		 470 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0235  ImpA domain protein  17.33 
 
 		 470 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0229  ImpA domain-containing protein  17.42 
 
 		 470 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.865531  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0398  type VI secretion-associated protein  19.94 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0325  ImpA domain-containing protein  19.94 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4072  hypothetical protein  18.89 
 
 		 488 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00713132  unclonable  0.00000101691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3222  type VI secretion-associated protein  20.77 
 
 		 487 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1125  putative type VI secretion protein VasJ  28.48 
 
 		 513 aa  44.3  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2795  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  19.11 
 
 		 479 aa  43.9  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  21.86 
 
 		 789 aa  43.9  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>