53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1296 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1296  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 373 aa  768    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1948  phosphotransferase domain-containing protein  55.08 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1125  PHP-like  55.26 
 
 		 380 aa  427  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  54.44 
 
 		 372 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  42.49 
 
 		 457 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  41.82 
 
 		 409 aa  300  2e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  38.26 
 
 		 394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  43.52 
 
 		 401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  38.79 
 
 		 393 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  37.99 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1581  phosphotransferase domain-containing protein  38.26 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1319  phosphotransferase domain-containing protein  34.77 
 
 		 424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  32.77 
 
 		 408 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  32.19 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  33.25 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  32.29 
 
 		 1078 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  31.73 
 
 		 1075 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  31.58 
 
 		 1033 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  31.39 
 
 		 411 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.74 
 
 		 1089 aa  162  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  31.73 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  31.58 
 
 		 446 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  30.6 
 
 		 1001 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  32.3 
 
 		 1089 aa  156  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  31.19 
 
 		 1161 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  30.9 
 
 		 1082 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  29.68 
 
 		 1050 aa  151  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  30.38 
 
 		 1132 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  31.14 
 
 		 1027 aa  149  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  29.9 
 
 		 1244 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  29.51 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  28.78 
 
 		 1127 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  30.07 
 
 		 1174 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  29.62 
 
 		 1062 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  31.25 
 
 		 1032 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  30.02 
 
 		 1124 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06840  conserved hypothetical protein TIGR00375  29.5 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  28.98 
 
 		 1067 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2262  hypothetical protein  35.96 
 
 		 387 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1553  hypothetical protein  27.25 
 
 		 390 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  33.44 
 
 		 1232 aa  129  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  28.91 
 
 		 1156 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0355  hypothetical protein  29.98 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1343  PHP domain protein  25.26 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0598  hypothetical protein  28.35 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1753  hypothetical protein  29.93 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.800597  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0363  hypothetical protein  28 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1672  hypothetical protein  26.83 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.530783  normal  0.0149602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3463  hypothetical protein  27.44 
 
 		 387 aa  99.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0239396  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0352  isoleucyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 224 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0095  PHP domain protein  23.15 
 
 		 251 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000129632 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0337  PHP-like protein  23.53 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2143  phosphotransferase domain-containing protein  31.63 
 
 		 235 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>