More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2772 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  75.14 
 
 
529 aa  800    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  89.37 
 
 
527 aa  955    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  80.46 
 
 
525 aa  826    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  80.46 
 
 
525 aa  826    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  100 
 
 
527 aa  1052    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  80.46 
 
 
525 aa  826    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  56.46 
 
 
528 aa  544  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  54.37 
 
 
532 aa  518  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.94 
 
 
518 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  54.48 
 
 
521 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  56.08 
 
 
524 aa  496  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.16 
 
 
572 aa  491  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  55.32 
 
 
545 aa  479  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  53.44 
 
 
531 aa  475  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  53.14 
 
 
540 aa  465  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  49.72 
 
 
521 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  49.54 
 
 
550 aa  429  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  49.14 
 
 
520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  49.59 
 
 
534 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.02 
 
 
533 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  38.07 
 
 
556 aa  345  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.04 
 
 
557 aa  331  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  36.7 
 
 
583 aa  331  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  35.34 
 
 
552 aa  331  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  35.14 
 
 
584 aa  330  6e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.27 
 
 
568 aa  325  9e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  33.75 
 
 
563 aa  325  1e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  34 
 
 
554 aa  318  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  37.27 
 
 
531 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  37.08 
 
 
531 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.26 
 
 
531 aa  310  5e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  34.24 
 
 
559 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.43 
 
 
579 aa  297  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.72 
 
 
534 aa  297  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  35.64 
 
 
538 aa  297  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.62 
 
 
565 aa  293  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  29.47 
 
 
586 aa  280  4e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  40.51 
 
 
546 aa  269  8e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.45 
 
 
536 aa  264  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.1 
 
 
535 aa  262  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.88 
 
 
564 aa  254  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  33.6 
 
 
534 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  38.1 
 
 
527 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  33.68 
 
 
502 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  32.7 
 
 
534 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  36.79 
 
 
532 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  36.8 
 
 
531 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  36.69 
 
 
532 aa  230  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.82 
 
 
510 aa  229  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.88 
 
 
467 aa  226  8e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  35.96 
 
 
470 aa  226  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.84 
 
 
520 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  33.49 
 
 
465 aa  211  3e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  33.96 
 
 
517 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  34.89 
 
 
520 aa  206  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.55 
 
 
516 aa  204  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.41 
 
 
516 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.17 
 
 
523 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  33.99 
 
 
513 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  28.34 
 
 
484 aa  180  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  27.16 
 
 
554 aa  171  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  27.82 
 
 
484 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  27.82 
 
 
484 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  27.82 
 
 
484 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  27.82 
 
 
484 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  28.02 
 
 
484 aa  169  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  28.02 
 
 
484 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.82 
 
 
484 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  27.4 
 
 
484 aa  167  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.81 
 
 
457 aa  167  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  28.51 
 
 
451 aa  152  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.25 
 
 
467 aa  150  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30 
 
 
477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.18 
 
 
472 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.87 
 
 
462 aa  146  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29 
 
 
488 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  29.84 
 
 
454 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.66 
 
 
469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  31.7 
 
 
453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.21 
 
 
469 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1458  FAD linked oxidase domain protein  29.73 
 
 
478 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.01 
 
 
469 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  36.43 
 
 
572 aa  140  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.22 
 
 
469 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.02 
 
 
469 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  26.65 
 
 
470 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  27.78 
 
 
469 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  26.65 
 
 
470 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  29.02 
 
 
469 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  28.34 
 
 
452 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.99 
 
 
474 aa  137  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1985  FAD linked oxidase-like  29.62 
 
 
465 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  26.45 
 
 
470 aa  136  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.45 
 
 
470 aa  136  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.71 
 
 
470 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.78 
 
 
447 aa  136  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.32 
 
 
474 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.24 
 
 
470 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.31 
 
 
470 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6133  putative D-lactate dehydrogenase (D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase)  28.02 
 
 
473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0750595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>