199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4557 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 330 aa  658    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  98.79 
 
 		 330 aa  651    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  92.68 
 
 		 329 aa  588  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1114  alpha/beta hydrolase fold  74.36 
 
 		 347 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  71.15 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0411  alpha/beta hydrolase fold  69.93 
 
 		 333 aa  361  8e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0956  alpha/beta hydrolase fold  49.52 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  48.54 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  48.08 
 
 		 344 aa  281  9e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4534  alpha/beta hydrolase fold  48.24 
 
 		 314 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  47.59 
 
 		 315 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  51.82 
 
 		 345 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  45.66 
 
 		 315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0871  alpha/beta hydrolase fold  46.96 
 
 		 314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  47.78 
 
 		 315 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  46.65 
 
 		 314 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  45.51 
 
 		 330 aa  249  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  42.58 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  42.58 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  42.77 
 
 		 323 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  42 
 
 		 303 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  39.56 
 
 		 324 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  39.06 
 
 		 324 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  38.34 
 
 		 337 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  38.62 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  36.39 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0780  alpha/beta hydrolase fold protein  35.5 
 
 		 314 aa  149  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.0368265 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  35.69 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  35.21 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  30.28 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  35.23 
 
 		 329 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  31.03 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 329 aa  119  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  32.54 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  32.54 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1082  lysophospholipase L2  33.33 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  33.33 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  30.93 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  33.71 
 
 		 345 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  34.34 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  31.6 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  29.96 
 
 		 638 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  32.96 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  33.46 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  30.88 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  29.17 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  32.47 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  32.85 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  32.47 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  32.47 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  32.47 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  32.47 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  33.45 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  34.02 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  33.09 
 
 		 330 aa  106  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  27.64 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  33.7 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  33.7 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  33.7 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  33.7 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  33.7 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  33.7 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  33.7 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  33.7 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  33.7 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  30 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  28.31 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  27.9 
 
 		 329 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2752  lysophospholipase L2, putative  30.55 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319017  hitchhiker  0.00474393 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1375  Lysophospholipase  25.44 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  28.95 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.63 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2780  hypothetical protein  29.08 
 
 		 580 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0442917  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  25.64 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>