More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2106 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  98.6 
 
 		 358 aa  684    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  92.46 
 
 		 358 aa  644    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 358 aa  692    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  77.53 
 
 		 358 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  77.09 
 
 		 359 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  77.22 
 
 		 359 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.66 
 
 		 364 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.22 
 
 		 364 aa  391  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.04 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  59.83 
 
 		 374 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.32 
 
 		 364 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.54 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.76 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.63 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  57.93 
 
 		 348 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.67 
 
 		 364 aa  342  7e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.67 
 
 		 364 aa  342  7e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.97 
 
 		 364 aa  341  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.43 
 
 		 363 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.56 
 
 		 362 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.17 
 
 		 362 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.74 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  54.42 
 
 		 361 aa  320  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.26 
 
 		 357 aa  318  7.999999999999999e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.3 
 
 		 362 aa  316  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.39 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.86 
 
 		 349 aa  315  9e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.72 
 
 		 363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.14 
 
 		 356 aa  305  8.000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.7 
 
 		 348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.42 
 
 		 352 aa  301  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.14 
 
 		 354 aa  298  7e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.76 
 
 		 356 aa  296  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.53 
 
 		 352 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  47.51 
 
 		 384 aa  296  4e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.07 
 
 		 352 aa  290  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.55 
 
 		 355 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  48.86 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  46.93 
 
 		 367 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.45 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.82 
 
 		 347 aa  276  3e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.82 
 
 		 347 aa  276  3e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.88 
 
 		 362 aa  276  3e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.45 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  47.66 
 
 		 361 aa  276  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.52 
 
 		 355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.86 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.32 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.57 
 
 		 365 aa  269  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.86 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.2 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.08 
 
 		 333 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1784  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.08 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.92 
 
 		 364 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  43.38 
 
 		 355 aa  262  4.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 344 aa  263  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.51 
 
 		 360 aa  262  6.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.57 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.26 
 
 		 351 aa  259  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.02 
 
 		 351 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.07 
 
 		 364 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.15 
 
 		 361 aa  259  6e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  43.84 
 
 		 348 aa  259  7e-68  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  44.67 
 
 		 349 aa  258  8e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.53 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.35 
 
 		 336 aa  258  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.29 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.02 
 
 		 351 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.29 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.2 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.23 
 
 		 339 aa  257  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.68 
 
 		 345 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.75 
 
 		 336 aa  256  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.93 
 
 		 353 aa  255  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  43.8 
 
 		 357 aa  255  7e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.35 
 
 		 358 aa  255  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.68 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.26 
 
 		 377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.52 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.22 
 
 		 353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.68 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  42.9 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.94 
 
 		 363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.13 
 
 		 344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  41.04 
 
 		 336 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  41.64 
 
 		 456 aa  252  6e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.13 
 
 		 360 aa  252  7e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  42.27 
 
 		 336 aa  252  8.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  41.46 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.27 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.98 
 
 		 349 aa  251  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  43.58 
 
 		 340 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.19 
 
 		 335 aa  250  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  45.85 
 
 		 361 aa  249  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.09 
 
 		 348 aa  249  6e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.24 
 
 		 350 aa  249  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.25 
 
 		 345 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0837713  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.9 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0394  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.25 
 
 		 345 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1736  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.25 
 
 		 345 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.575545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>