52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1107 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  82.95 
 
 		 394 aa  692    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  84.22 
 
 		 394 aa  703    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  100 
 
 		 393 aa  808    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1581  phosphotransferase domain-containing protein  82.95 
 
 		 394 aa  687    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1319  phosphotransferase domain-containing protein  59.57 
 
 		 424 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  44.19 
 
 		 457 aa  335  7e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  43.56 
 
 		 409 aa  329  6e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  42.89 
 
 		 401 aa  323  2e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1948  phosphotransferase domain-containing protein  39.31 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  40.11 
 
 		 372 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1296  TPR repeat-containing protein  38.79 
 
 		 373 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1125  PHP-like  40.53 
 
 		 380 aa  276  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2262  hypothetical protein  35.87 
 
 		 387 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  33.5 
 
 		 414 aa  186  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.76 
 
 		 1089 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  30.66 
 
 		 1050 aa  176  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  28.91 
 
 		 1033 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06840  conserved hypothetical protein TIGR00375  32.27 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  28.2 
 
 		 1001 aa  172  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0363  hypothetical protein  33.41 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1553  hypothetical protein  32.2 
 
 		 390 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  28.33 
 
 		 1078 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  27.47 
 
 		 411 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  28.54 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  27.23 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  27.82 
 
 		 1161 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  29.31 
 
 		 1032 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  29.61 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  27.25 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0598  hypothetical protein  31.03 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  26.88 
 
 		 1075 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  27.16 
 
 		 1244 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  26.35 
 
 		 1174 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  26.64 
 
 		 1124 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  27.59 
 
 		 1089 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0355  hypothetical protein  32.68 
 
 		 392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1343  PHP domain protein  31.44 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 1132 aa  150  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  25.96 
 
 		 1127 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  27.47 
 
 		 1027 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  27.38 
 
 		 446 aa  147  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1753  hypothetical protein  28.68 
 
 		 386 aa  145  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.800597  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  26.18 
 
 		 1156 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  26.81 
 
 		 1082 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1672  hypothetical protein  28.71 
 
 		 397 aa  136  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.530783  normal  0.0149602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  26.79 
 
 		 1062 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  28.21 
 
 		 1232 aa  130  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  26.17 
 
 		 1067 aa  126  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3463  hypothetical protein  30.03 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0239396  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0337  PHP-like protein  26.83 
 
 		 236 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268427  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1418  phosphotransferase domain-containing protein  25.87 
 
 		 299 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.105026  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1268  phosphotransferase domain-containing protein  26.87 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>