More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0051 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
146 aa  293  7e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  78.62 
 
 
145 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  76.39 
 
 
145 aa  238  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  75.17 
 
 
145 aa  233  6e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  61.11 
 
 
160 aa  204  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.5 
 
 
145 aa  203  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  63.45 
 
 
145 aa  201  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1980  cytosine deaminase  59.03 
 
 
145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.597926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3776  cytosine deaminase  62.07 
 
 
145 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.650074  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.11 
 
 
145 aa  196  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  61.38 
 
 
145 aa  195  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  61.11 
 
 
146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1635  cytosine deaminase  60.69 
 
 
145 aa  194  5.000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.503034  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0907  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  54.79 
 
 
146 aa  189  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3229  cytosine deaminase  57.24 
 
 
145 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3086  cytosine deaminase  57.24 
 
 
145 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1290  Cytosine deaminase  57.24 
 
 
145 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.589706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  55.17 
 
 
149 aa  183  8e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  55.86 
 
 
145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  55.17 
 
 
145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3077  cytosine deaminase  56.55 
 
 
145 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  55.17 
 
 
145 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.48 
 
 
145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  55.86 
 
 
145 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  57.33 
 
 
177 aa  179  9.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  54.17 
 
 
145 aa  174  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2556  cytosine deaminase  53.47 
 
 
149 aa  174  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00990  cytosine/adenosine deaminase  50.69 
 
 
175 aa  173  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1318  hypothetical protein  53.42 
 
 
151 aa  172  9e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4144  cytosine deaminase  53.96 
 
 
154 aa  169  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  54.86 
 
 
143 aa  167  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.23 
 
 
274 aa  166  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.79 
 
 
147 aa  166  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1435  Cytosine deaminase  51.77 
 
 
153 aa  165  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.317365  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0864  Cytosine deaminase  47.48 
 
 
165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.32 
 
 
139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.32 
 
 
139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.66 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  54.17 
 
 
150 aa  161  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.34 
 
 
143 aa  160  7e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1414  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.47 
 
 
143 aa  155  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  48.28 
 
 
144 aa  155  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2579  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.83 
 
 
146 aa  145  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3606  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.89 
 
 
154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3674  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.89 
 
 
154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3601  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  45.89 
 
 
154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00422327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  49.61 
 
 
176 aa  143  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.14 
 
 
164 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05950  cytosine deaminase, putative  45.58 
 
 
165 aa  135  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275444  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3461  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.66 
 
 
150 aa  135  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04267  cytosine deaminase  43.06 
 
 
151 aa  131  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205672  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2066  Cytosine deaminase  39.73 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0824  cytosine deaminase  49.65 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.385917  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5409  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.29 
 
 
158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210093  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  38.89 
 
 
172 aa  97.8  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  48.15 
 
 
170 aa  94.7  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3893  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.92 
 
 
161 aa  94.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.26 
 
 
150 aa  92  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.92 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  43.69 
 
 
152 aa  92  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  34.75 
 
 
177 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  41.75 
 
 
189 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.68 
 
 
156 aa  90.1  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.24 
 
 
168 aa  86.7  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4222  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.31 
 
 
157 aa  86.7  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  32.37 
 
 
183 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.16 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  35.92 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0274  tRNA-adenosine deaminase  42.98 
 
 
168 aa  85.5  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1525  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.57 
 
 
147 aa  84.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.14 
 
 
182 aa  84.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.14 
 
 
182 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.4 
 
 
150 aa  83.6  8e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.96 
 
 
158 aa  83.6  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.35 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  40.78 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  42.72 
 
 
171 aa  82  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  40.78 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1284  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.83 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.18 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  40.78 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04155  putative cytosine/adenosine deaminase  40.38 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411988  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4304  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.86 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0110494  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.5 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.29 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  32.88 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0017  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.83 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.29 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.1 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  32.43 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  32.88 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.38 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.46 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  32.88 
 
 
178 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.88 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  32.88 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  32.88 
 
 
178 aa  80.5  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  32.88 
 
 
178 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  32.88 
 
 
178 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>