More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4503 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  100 
 
 
408 aa  822  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  58.66 
 
 
405 aa  463  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  50.25 
 
 
425 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  49.01 
 
 
409 aa  364  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  49.63 
 
 
414 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  44.74 
 
 
413 aa  343  3e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  44.74 
 
 
420 aa  342  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  47.27 
 
 
403 aa  342  6e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  46.81 
 
 
461 aa  338  1e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  44.23 
 
 
413 aa  337  3e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  43.98 
 
 
413 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  43.2 
 
 
411 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  46.38 
 
 
413 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  44.53 
 
 
418 aa  331  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  45.3 
 
 
411 aa  331  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  41.3 
 
 
416 aa  326  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  42.54 
 
 
412 aa  322  8e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  41.77 
 
 
436 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  43.37 
 
 
417 aa  319  6e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  43 
 
 
419 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  43.84 
 
 
411 aa  315  8e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  42.51 
 
 
419 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  42.61 
 
 
411 aa  307  2e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  44.32 
 
 
405 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  41.16 
 
 
413 aa  292  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  42.18 
 
 
415 aa  290  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  44.12 
 
 
425 aa  287  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  41.79 
 
 
407 aa  286  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  41.77 
 
 
443 aa  284  2e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  38.66 
 
 
445 aa  273  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  39.49 
 
 
391 aa  272  7e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  40.1 
 
 
406 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  40.49 
 
 
428 aa  268  9e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  42.11 
 
 
393 aa  260  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  36.36 
 
 
412 aa  259  5e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  35.89 
 
 
412 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  34.83 
 
 
420 aa  235  8e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  34.52 
 
 
461 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  34.58 
 
 
419 aa  226  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  34.2 
 
 
445 aa  224  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  33.49 
 
 
436 aa  223  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  35.68 
 
 
433 aa  223  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  35.41 
 
 
456 aa  222  9e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  33.73 
 
 
478 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  34.76 
 
 
486 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  33.73 
 
 
434 aa  213  4e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  33.9 
 
 
426 aa  212  8e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  33.18 
 
 
440 aa  210  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  34.73 
 
 
447 aa  209  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  33.73 
 
 
482 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  31.19 
 
 
429 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  34.53 
 
 
407 aa  198  1e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  34.8 
 
 
451 aa  198  1e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  33.1 
 
 
426 aa  196  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  31.24 
 
 
444 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  31.02 
 
 
490 aa  189  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  32.95 
 
 
447 aa  185  1e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  30.48 
 
 
413 aa  183  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  31.92 
 
 
445 aa  182  8e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  32.53 
 
 
421 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  33.42 
 
 
433 aa  179  6e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  31.97 
 
 
407 aa  179  6e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  32.67 
 
 
437 aa  178  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  30.1 
 
 
431 aa  176  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  32.09 
 
 
407 aa  175  1e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  33.33 
 
 
438 aa  174  4e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  30 
 
 
440 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  27.16 
 
 
426 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  32.51 
 
 
447 aa  169  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  32.24 
 
 
412 aa  169  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  31.59 
 
 
444 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.1 
 
 
426 aa  167  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.93 
 
 
430 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  34.17 
 
 
433 aa  167  3e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  31.3 
 
 
455 aa  167  3e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  33.65 
 
 
419 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  29.06 
 
 
441 aa  166  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  29.02 
 
 
431 aa  165  1e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  34.01 
 
 
433 aa  165  2e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  32.86 
 
 
408 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  32.86 
 
 
408 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  31.03 
 
 
470 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  31.6 
 
 
459 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  32.86 
 
 
408 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  30.02 
 
 
423 aa  162  8e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  29.58 
 
 
434 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  30.35 
 
 
428 aa  159  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  30.1 
 
 
444 aa  159  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  31.4 
 
 
400 aa  159  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  34.54 
 
 
408 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  31.71 
 
 
432 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  28.34 
 
 
459 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  31.53 
 
 
411 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  31.29 
 
 
421 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  28.67 
 
 
405 aa  156  5e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  28.61 
 
 
430 aa  156  5e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  30.1 
 
 
429 aa  153  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  31.41 
 
 
404 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  30.37 
 
 
407 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  30.02 
 
 
414 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>