59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4238 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4238  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  316  9e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0673449  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4162  hypothetical protein  47.22 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0787626  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9804  helix turn helix transcriptional regulator  47.18 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4548  helix-turn-helix domain-containing protein  46.46 
 
 		 181 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4600  helix-turn-helix domain-containing protein  43.75 
 
 		 176 aa  121  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6378  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9645  hypothetical protein  46.97 
 
 		 163 aa  114  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.085349  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9872  hypothetical protein  32.14 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5909  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4907  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0998227 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15940  predicted transcriptional regulator  28.83 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0473945  hitchhiker  0.000000239728 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2806  putative transcriptional regulatory protein  31.88 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2104  transcriptional regulator, XRE family  30.49 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3121  helix-turn-helix domain protein  29.69 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0021  XRE family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6062  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  28.7 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1061  XRE family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 155 aa  44.3  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.161431  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0894  transcriptional regulator  25.71 
 
 		 215 aa  43.9  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4575  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.810922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0595  XRE family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0019  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0558597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0473  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0237  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5287  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.511676  normal  0.279945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0447  transcriptional regulator, XRE family  28.79 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28910  Helix-turn-helix protein  37.14 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.38358 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0026  XRE family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1248  DNA-binding protein  27.85 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.821781  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6091  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  36 
 
 		 255 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 113 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0051  XRE family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 138 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  35 
 
 		 303 aa  41.6  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1142  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 141 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343255  normal  0.597064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2892  transcriptional regulator, XRE family  28.17 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.203012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1035  transcriptional regulator, XRE family  30.38 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 261 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3208  transcriptional regulator, XRE family  28.79 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1118  putative transcriptional regulator  25.35 
 
 		 213 aa  40.8  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2959  transcriptional regulator, XRE family  27.5 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676432  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 488 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2505  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2415  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.747648  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6504  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6604  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.608837  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 186 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>