More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1778 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  78.4 
 
 
413 aa  692  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  81.01 
 
 
414 aa  704  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  80.43 
 
 
414 aa  699  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  77.64 
 
 
416 aa  677  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  78.4 
 
 
413 aa  689  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  79.37 
 
 
413 aa  693  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  79.95 
 
 
414 aa  696  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
413 aa  855  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  70.44 
 
 
415 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.6 
 
 
414 aa  610  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  71.46 
 
 
414 aa  610  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.38 
 
 
415 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  69.17 
 
 
413 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.63 
 
 
428 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.99 
 
 
418 aa  587  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  67.24 
 
 
418 aa  588  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  67.4 
 
 
415 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  67.65 
 
 
413 aa  587  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  67.48 
 
 
420 aa  583  1e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  67.98 
 
 
414 aa  582  1e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  67.24 
 
 
414 aa  582  1e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  67.16 
 
 
413 aa  583  1e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  63.12 
 
 
414 aa  578  1e-164  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.04 
 
 
414 aa  580  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.67 
 
 
415 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  66.33 
 
 
426 aa  572  1e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.67 
 
 
419 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  61.33 
 
 
406 aa  525  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.28 
 
 
408 aa  521  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.07 
 
 
407 aa  520  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.56 
 
 
406 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  62.07 
 
 
406 aa  515  1e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.32 
 
 
406 aa  516  1e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  59.61 
 
 
406 aa  499  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.06 
 
 
403 aa  491  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.71 
 
 
413 aa  477  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  54.3 
 
 
422 aa  471  1e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.7 
 
 
429 aa  469  1e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  55.2 
 
 
414 aa  469  1e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  53.47 
 
 
420 aa  462  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.07 
 
 
418 aa  456  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.58 
 
 
421 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.93 
 
 
451 aa  451  1e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.21 
 
 
412 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  3.85676e-08  unclonable  1.52095e-15 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.7 
 
 
417 aa  447  1e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  51.63 
 
 
405 aa  444  1e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.02 
 
 
404 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  51.63 
 
 
405 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.29 
 
 
419 aa  444  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.02 
 
 
657 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.09 
 
 
416 aa  443  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.36 
 
 
406 aa  439  1e-122  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.1 
 
 
429 aa  441  1e-122  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  49.88 
 
 
425 aa  439  1e-122  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.93 
 
 
414 aa  441  1e-122  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.4 
 
 
418 aa  441  1e-122  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.77 
 
 
678 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.61 
 
 
429 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  51.86 
 
 
414 aa  438  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.36 
 
 
429 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  52.05 
 
 
421 aa  435  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.38 
 
 
408 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.99 
 
 
406 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  51.12 
 
 
416 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.01 
 
 
774 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.61 
 
 
415 aa  433  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  51.26 
 
 
626 aa  432  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.27 
 
 
662 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.94 
 
 
605 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.01 
 
 
621 aa  428  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.87 
 
 
416 aa  429  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.43 
 
 
427 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.02 
 
 
650 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.52 
 
 
419 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  53.27 
 
 
604 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  53.27 
 
 
604 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  53.47 
 
 
661 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.76 
 
 
666 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  49.02 
 
 
423 aa  428  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.12 
 
 
418 aa  425  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  51 
 
 
629 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  52.51 
 
 
666 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  51.51 
 
 
682 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.25 
 
 
406 aa  425  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.76 
 
 
420 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  2.91669e-06 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  49.63 
 
 
419 aa  425  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.25 
 
 
406 aa  425  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  50.37 
 
 
413 aa  426  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.1 
 
 
416 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  49.25 
 
 
406 aa  423  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  49 
 
 
406 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  49 
 
 
406 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  49.25 
 
 
406 aa  423  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.23 
 
 
413 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  49 
 
 
406 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  49 
 
 
406 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  49 
 
 
406 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  49.25 
 
 
406 aa  423  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  49.25 
 
 
406 aa  421  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.21 
 
 
411 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>