More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5679 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5679  ABC transporter related  100 
 
 		 270 aa  527  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  66.42 
 
 		 271 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  66.17 
 
 		 271 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  64.55 
 
 		 271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3151  ABC transporter related  65.92 
 
 		 271 aa  288  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2926  ABC transporter related  67.19 
 
 		 271 aa  287  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.214011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  48.82 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  43.58 
 
 		 266 aa  202  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  46.15 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  49.01 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  48.22 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  42.25 
 
 		 257 aa  195  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  45.85 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  47.64 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  46.25 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  46.77 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  48.25 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2511  ABC transporter related  51.36 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  45 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  42.35 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.96 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  48.74 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  36.4 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  44.96 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  44.66 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  41.6 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2740  ABC transporter related  48.05 
 
 		 264 aa  181  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  45.87 
 
 		 255 aa  181  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  41.88 
 
 		 490 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  37.08 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 536 aa  179  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  41.43 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  45.92 
 
 		 262 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  42.41 
 
 		 414 aa  175  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.33 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  41.92 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  34.92 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1929  ABC Fe+3 siderophore/cobalamin transporter, ATPase subunit  44.71 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051174  normal  0.251825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  42.8 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  34.44 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.25 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  39.08 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50330  iron(III)-siderophore ABC transporter ATP-binding protein  40.6 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219188  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  41.28 
 
 		 267 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  43.85 
 
 		 278 aa  168  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  46.61 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  43.09 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  38.46 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  36.44 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  39.53 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  43.5 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  35.93 
 
 		 405 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3732  ABC transporter related protein  38.56 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  41.92 
 
 		 419 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  36.44 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2405  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  43.87 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  40 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1068  ABC transporter related  43.87 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  44.36 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  41.32 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  44.3 
 
 		 424 aa  166  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1051  ABC transporter related  40.43 
 
 		 255 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3325  ABC transporter-related protein  48.42 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946255  normal  0.977601 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  45.29 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3617  ABC transporter related  44.76 
 
 		 270 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3549  ABC transporter-related protein  44.76 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0341647  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  42.68 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  45.57 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  43.9 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  37.24 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  36.82 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.13 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.97 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0491  ABC transporter component  44.78 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  41.32 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3581  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ferrichrome)  39.08 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1385  ABC transporter related  45 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  37.02 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  40.32 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  34.31 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.17 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  33.72 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  34.73 
 
 		 275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3466  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  43.95 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39496  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  32.92 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4385  ABC transporter related  43.78 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  40.15 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.31 
 
 		 273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.31 
 
 		 273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  38.17 
 
 		 263 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.57 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.31 
 
 		 273 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  38.98 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.31 
 
 		 273 aa  161  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  38.02 
 
 		 271 aa  161  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>