More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2126 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  299  7.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  76.81 
 
 		 143 aa  236  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  77.78 
 
 		 145 aa  225  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  74.83 
 
 		 144 aa  225  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  75.18 
 
 		 142 aa  224  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  78.1 
 
 		 143 aa  223  7e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  77.95 
 
 		 129 aa  215  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  77.6 
 
 		 149 aa  209  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  75.21 
 
 		 127 aa  197  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  72.88 
 
 		 125 aa  192  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  71.9 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  66.67 
 
 		 153 aa  189  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  67.48 
 
 		 123 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  66.67 
 
 		 124 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  64 
 
 		 146 aa  173  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  65 
 
 		 138 aa  172  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  62.18 
 
 		 131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  57.93 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  60.98 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  63.03 
 
 		 129 aa  167  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  56.55 
 
 		 173 aa  167  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  63.56 
 
 		 122 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  71.54 
 
 		 129 aa  163  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.88 
 
 		 137 aa  157  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  61.86 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0409  scaffold protein  57.26 
 
 		 138 aa  151  2e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  64.08 
 
 		 125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  57.81 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0630  scaffold protein  51.85 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.17 
 
 		 139 aa  149  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  57.6 
 
 		 133 aa  149  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  56 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  56 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  55 
 
 		 137 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.76 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  57.14 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  57.94 
 
 		 128 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.76 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  57.14 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0886  scaffold protein  57.14 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272267  hitchhiker  0.000151152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  57.14 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  55.56 
 
 		 128 aa  147  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  55.56 
 
 		 128 aa  147  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.86 
 
 		 277 aa  148  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1424  iron-binding protein IscU  57.14 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  51.82 
 
 		 138 aa  147  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.28 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  54.33 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  55.56 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  56.35 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  55.2 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.8 
 
 		 284 aa  147  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4611  scaffold protein  57.14 
 
 		 128 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.8 
 
 		 284 aa  147  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  56.25 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40390  scaffold protein  56.35 
 
 		 128 aa  146  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  54.33 
 
 		 128 aa  147  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1325  scaffold protein  57.26 
 
 		 128 aa  146  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  56.25 
 
 		 153 aa  146  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.71 
 
 		 286 aa  146  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  56.25 
 
 		 153 aa  146  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  56.35 
 
 		 139 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  56.45 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  50.77 
 
 		 133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  56.45 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  54.4 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.4 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.6 
 
 		 132 aa  145  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.84 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  49.29 
 
 		 291 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.8 
 
 		 135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  51.67 
 
 		 139 aa  144  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.29 
 
 		 291 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  50 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0718  scaffold protein  58.06 
 
 		 125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.33 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  54.03 
 
 		 135 aa  144  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.84 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.24 
 
 		 135 aa  143  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  52.8 
 
 		 138 aa  143  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  54.4 
 
 		 143 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.33 
 
 		 134 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.4 
 
 		 143 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  55.65 
 
 		 130 aa  143  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  51.56 
 
 		 182 aa  142  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.2 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  50 
 
 		 211 aa  143  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0302  scaffold protein  50 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  53.23 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  54.84 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3626  scaffold protein  54.84 
 
 		 128 aa  143  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.284747  normal  0.811196 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.3 
 
 		 284 aa  142  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  53.23 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  55.65 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  50.81 
 
 		 211 aa  142  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  55.65 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1239  scaffold protein  55.65 
 
 		 126 aa  141  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  54.84 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.54 
 
 		 207 aa  141  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  52.42 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>