More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1721 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  66.16 
 
 		 865 aa  1239    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 886 aa  798    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  55.57 
 
 		 869 aa  1000    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  70.35 
 
 		 863 aa  1319    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  70.5 
 
 		 863 aa  1323    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 858 aa  635    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 864 aa  1809    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  67.68 
 
 		 865 aa  1273    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 886 aa  807    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 		 865 aa  1015    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  56.69 
 
 		 855 aa  976    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 886 aa  802    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 886 aa  803    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 906 aa  783    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 809 aa  712    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 905 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 908 aa  578  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 896 aa  575  1.0000000000000001e-162  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 928 aa  560  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 892 aa  543  1e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 816 aa  512  1e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 802 aa  512  1e-143  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 		 808 aa  504  1e-141  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 808 aa  483  1e-135  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 		 864 aa  477  1e-133  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 799 aa  477  1e-133  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 799 aa  479  1e-133  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 799 aa  473  1e-132  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 799 aa  476  1e-132  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 806 aa  464  1e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 881 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 		 881 aa  459  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 		 771 aa  459  1e-127  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 894 aa  458  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 877 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 885 aa  450  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  34.49 
 
 		 858 aa  450  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  33.87 
 
 		 836 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 881 aa  452  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  34.98 
 
 		 846 aa  452  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  35.31 
 
 		 886 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  34.16 
 
 		 861 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 		 882 aa  442  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  33.57 
 
 		 916 aa  444  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 		 906 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 		 876 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 885 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 879 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 		 855 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  34.17 
 
 		 925 aa  441  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 		 845 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 880 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 		 880 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 		 902 aa  435  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 880 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 		 883 aa  431  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 881 aa  427  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  32.69 
 
 		 895 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 		 885 aa  425  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 		 903 aa  424  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 882 aa  426  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 873 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 		 872 aa  426  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 		 865 aa  421  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 901 aa  422  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 865 aa  421  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2238  valyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 884 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.180056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  32.07 
 
 		 911 aa  419  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 		 883 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 		 860 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 867 aa  417  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 881 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 884 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 		 884 aa  412  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0251  valyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 886 aa  410  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 		 862 aa  411  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 		 879 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 		 881 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 		 881 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 		 874 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 866 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2685  valyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 		 888 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000391784 
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 880 aa  405  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 880 aa  405  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1531  valyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 		 888 aa  406  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 		 881 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 		 881 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0010  valyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 		 922 aa  405  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.885408  hitchhiker  0.00234532 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 872 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 881 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 		 881 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 881 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 881 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 		 881 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  33.07 
 
 		 887 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 881 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 880 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 881 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2765  valyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 		 883 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.700056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 871 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>