44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0846 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  100 
 
 		 415 aa  825    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  67.93 
 
 		 417 aa  570  1e-161  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  65.06 
 
 		 408 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  54.36 
 
 		 434 aa  443  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  52.73 
 
 		 440 aa  425  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  47.7 
 
 		 438 aa  386  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  64.23 
 
 		 517 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  61.68 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  44.11 
 
 		 477 aa  358  9.999999999999999e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  46.47 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  57.93 
 
 		 491 aa  335  1e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  42.79 
 
 		 461 aa  334  2e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  56.9 
 
 		 505 aa  332  9e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  58.55 
 
 		 443 aa  328  9e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  57.56 
 
 		 464 aa  325  1e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  59.51 
 
 		 438 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  60.87 
 
 		 438 aa  322  7e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  62.64 
 
 		 439 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  55.2 
 
 		 537 aa  296  4e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  41.47 
 
 		 426 aa  286  4e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  38.03 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  37.68 
 
 		 413 aa  271  1e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  39.13 
 
 		 402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  48.3 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  48.48 
 
 		 405 aa  259  9e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  48.68 
 
 		 407 aa  258  1e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  35.05 
 
 		 403 aa  256  5e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  41.43 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  34.83 
 
 		 584 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  35.05 
 
 		 539 aa  45.8  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0961  DNA primase  32.26 
 
 		 579 aa  45.8  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  34.62 
 
 		 573 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_002620  TC0175  DNA primase  38.03 
 
 		 600 aa  45.1  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  29.09 
 
 		 588 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  34.95 
 
 		 640 aa  44.7  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3106  DNA primase  37.8 
 
 		 678 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529982  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  29.27 
 
 		 678 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  43.86 
 
 		 577 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  43.86 
 
 		 578 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  29.9 
 
 		 653 aa  43.1  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  29.27 
 
 		 677 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  29.27 
 
 		 677 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  36.92 
 
 		 535 aa  43.1  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0761  DNA primase  40.68 
 
 		 607 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>