73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1769 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  100 
 
 		 475 aa  947    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  61.94 
 
 		 517 aa  600  1e-170  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  55.08 
 
 		 438 aa  498  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  61.68 
 
 		 415 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  43.83 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  40.98 
 
 		 477 aa  346  4e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  58.93 
 
 		 407 aa  340  4e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  54.34 
 
 		 408 aa  340  5e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  55.05 
 
 		 443 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  62.31 
 
 		 438 aa  333  5e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  57.3 
 
 		 464 aa  332  1e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  61.57 
 
 		 438 aa  330  4e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  62.12 
 
 		 439 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  39.92 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  39.96 
 
 		 461 aa  322  7e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  57.58 
 
 		 491 aa  322  8e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  40.79 
 
 		 440 aa  319  7.999999999999999e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  38.74 
 
 		 452 aa  318  2e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  57.63 
 
 		 505 aa  317  3e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  53.6 
 
 		 537 aa  297  3e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  37.13 
 
 		 413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  50.37 
 
 		 405 aa  279  9e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  49.26 
 
 		 403 aa  277  2e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  49.26 
 
 		 405 aa  277  3e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  50.94 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  48.89 
 
 		 407 aa  276  8e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  44.41 
 
 		 402 aa  264  2e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  39.53 
 
 		 380 aa  192  9e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0991  ribonuclease  54.55 
 
 		 1059 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4223  ribonuclease E  52.54 
 
 		 1053 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2176  restriction endonuclease  58 
 
 		 669 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2863  ribonuclease E  56 
 
 		 1088 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.829315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2918  ribonuclease E  56 
 
 		 1085 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000100731  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1814  ribonuclease E  56 
 
 		 1087 aa  53.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0112079  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0520  ribonuclease E  56 
 
 		 1090 aa  53.5  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000787566  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2491  ribonuclease E  56 
 
 		 1090 aa  53.5  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172006  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2791  ribonuclease E  56 
 
 		 1087 aa  53.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000882056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  25.95 
 
 		 582 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2802  ribonuclease E  56.6 
 
 		 1088 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000361809  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  25.32 
 
 		 582 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  25.32 
 
 		 582 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  25.32 
 
 		 582 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  32 
 
 		 573 aa  48.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  27.82 
 
 		 588 aa  47.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  24.68 
 
 		 584 aa  47.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0752  hypothetical protein  60.87 
 
 		 315 aa  47.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0183997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  24.69 
 
 		 581 aa  47  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2357  translation initiation factor IF-2  54.76 
 
 		 1101 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  24.69 
 
 		 581 aa  47  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  24.69 
 
 		 581 aa  47  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  24.69 
 
 		 581 aa  47  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  24.69 
 
 		 581 aa  47  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  24.69 
 
 		 581 aa  47  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  24.69 
 
 		 581 aa  47  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  25.76 
 
 		 584 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  35.8 
 
 		 539 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1062  ribonuclease E  59.52 
 
 		 1096 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  0.00000580995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  24.75 
 
 		 584 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  29.91 
 
 		 657 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  32.47 
 
 		 584 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  24.68 
 
 		 581 aa  45.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  23.23 
 
 		 581 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  24.24 
 
 		 584 aa  44.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  23.23 
 
 		 581 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  23.23 
 
 		 581 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  23.23 
 
 		 581 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  23.23 
 
 		 581 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0175  DNA primase  26.15 
 
 		 600 aa  44.3  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  24.07 
 
 		 581 aa  43.9  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  24.07 
 
 		 581 aa  43.9  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2621  hypothetical protein  50 
 
 		 401 aa  43.5  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.335901 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  28.15 
 
 		 577 aa  43.1  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2922  ribonuclease, Rne/Rng family  57.89 
 
 		 1097 aa  43.1  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000705961  normal  0.54344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>