31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0307 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  96.12 
 
 		 438 aa  832    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  94.08 
 
 		 439 aa  759    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  78.75 
 
 		 443 aa  689    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  100 
 
 		 438 aa  877    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  53.43 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  64.66 
 
 		 438 aa  355  1e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  62.31 
 
 		 475 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  60.9 
 
 		 517 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  60.87 
 
 		 415 aa  335  7.999999999999999e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  42.27 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  60.38 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  59.85 
 
 		 407 aa  321  9.999999999999999e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  41.46 
 
 		 440 aa  316  5e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  56.7 
 
 		 505 aa  310  5e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  55.3 
 
 		 461 aa  305  9.000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  38.38 
 
 		 477 aa  302  6.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  53.93 
 
 		 491 aa  301  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  51.16 
 
 		 408 aa  295  1e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  51.46 
 
 		 407 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  50.56 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  50.56 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  51.3 
 
 		 405 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  47.75 
 
 		 452 aa  282  7.000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  52.45 
 
 		 537 aa  280  3e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  37.76 
 
 		 426 aa  276  4e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  38.57 
 
 		 413 aa  265  2e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  36.9 
 
 		 402 aa  252  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  39.43 
 
 		 380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  28.48 
 
 		 584 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0504  DNA primase  45.45 
 
 		 604 aa  45.1  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.188131  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  43.4 
 
 		 662 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>