58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0699 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  100 
 
 		 417 aa  831    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  67.93 
 
 		 415 aa  570  1e-161  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  69.71 
 
 		 408 aa  548  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  51.95 
 
 		 434 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  50.91 
 
 		 440 aa  413  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  46.92 
 
 		 438 aa  386  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  44.04 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  61.31 
 
 		 517 aa  362  1e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  44.64 
 
 		 477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  63.57 
 
 		 505 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  63.02 
 
 		 407 aa  335  7.999999999999999e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  50.59 
 
 		 464 aa  335  9e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  61.28 
 
 		 491 aa  330  3e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  42.27 
 
 		 461 aa  328  9e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  57.51 
 
 		 443 aa  325  9e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  57.34 
 
 		 438 aa  318  9e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  60.38 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  60 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  56.4 
 
 		 537 aa  300  3e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  39.18 
 
 		 452 aa  294  2e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  38.83 
 
 		 405 aa  280  4e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  39.23 
 
 		 407 aa  279  9e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  38.2 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  38.26 
 
 		 405 aa  269  7e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  39.56 
 
 		 426 aa  269  8e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  38.83 
 
 		 402 aa  268  2e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  36.54 
 
 		 413 aa  264  2e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  42.92 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0961  DNA primase  29.36 
 
 		 579 aa  47  0.0007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  34.86 
 
 		 575 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  35.42 
 
 		 574 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  35.42 
 
 		 574 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  35.42 
 
 		 574 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  33.33 
 
 		 666 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  35.42 
 
 		 574 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  34.38 
 
 		 574 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  34.38 
 
 		 574 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  36.92 
 
 		 584 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  31.07 
 
 		 582 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  37.18 
 
 		 573 aa  44.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  34.38 
 
 		 574 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  34.38 
 
 		 574 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2777  hypothetical protein  26.92 
 
 		 907 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  29.31 
 
 		 577 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  29.31 
 
 		 577 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  34.38 
 
 		 574 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1484  hypothetical protein  26.92 
 
 		 919 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0431579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  34.38 
 
 		 574 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  32.8 
 
 		 576 aa  43.5  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0761  DNA primase  42.37 
 
 		 607 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  26.67 
 
 		 576 aa  43.1  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  29.91 
 
 		 581 aa  43.1  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  29.91 
 
 		 581 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  29.91 
 
 		 581 aa  43.1  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  29.91 
 
 		 581 aa  43.1  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  29.91 
 
 		 581 aa  43.1  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  29.91 
 
 		 581 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  29.91 
 
 		 581 aa  43.1  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>