30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1388 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  100 
 
 
438 aa  877    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  95.44 
 
 
439 aa  770    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  78.84 
 
 
443 aa  692    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  96.12 
 
 
438 aa  809    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  53.06 
 
 
464 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  64.29 
 
 
438 aa  354  2e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  61.57 
 
 
475 aa  342  8e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  59.51 
 
 
415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  60.15 
 
 
517 aa  336  5.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  57.34 
 
 
417 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  42.66 
 
 
434 aa  325  7e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  41.29 
 
 
440 aa  322  6e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  59.09 
 
 
407 aa  318  1e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  55.64 
 
 
505 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  55.3 
 
 
461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  37.92 
 
 
477 aa  299  6e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  53.18 
 
 
491 aa  297  3e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  56.02 
 
 
408 aa  296  7e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  52.04 
 
 
407 aa  286  5e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  50.56 
 
 
403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  50.56 
 
 
405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  51.3 
 
 
405 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  52.45 
 
 
537 aa  280  3e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  49.25 
 
 
452 aa  277  2e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  37.56 
 
 
426 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  38.6 
 
 
413 aa  261  2e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  36.9 
 
 
402 aa  253  5.000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  38.62 
 
 
380 aa  171  3e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  26.58 
 
 
584 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0504  DNA primase  44.44 
 
 
604 aa  43.5  0.008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.188131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>