31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1321 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  100 
 
 
403 aa  796    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  86.39 
 
 
405 aa  699    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  85.79 
 
 
405 aa  675    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  79.61 
 
 
407 aa  645    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  54.08 
 
 
452 aa  466  9.999999999999999e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  48.65 
 
 
426 aa  372  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  47.34 
 
 
402 aa  361  2e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  46.67 
 
 
413 aa  357  2.9999999999999997e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  44.19 
 
 
407 aa  322  8e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  40.97 
 
 
438 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  55.6 
 
 
464 aa  298  8e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  39.16 
 
 
434 aa  290  3e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  38.83 
 
 
417 aa  280  4e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  49.45 
 
 
443 aa  279  7e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  44.89 
 
 
475 aa  279  8e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  48.89 
 
 
517 aa  277  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  50.56 
 
 
438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  39.04 
 
 
438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  50.57 
 
 
439 aa  269  8e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  47.8 
 
 
408 aa  268  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  35.54 
 
 
415 aa  259  4e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  37.27 
 
 
440 aa  259  7e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  45.63 
 
 
461 aa  248  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  46.92 
 
 
505 aa  246  4e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  35.66 
 
 
477 aa  246  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  43.3 
 
 
537 aa  239  6.999999999999999e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  41.26 
 
 
491 aa  239  6.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  35.28 
 
 
380 aa  205  9e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  30.97 
 
 
588 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  40 
 
 
559 aa  44.3  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  27.42 
 
 
656 aa  42.7  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>