30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2135 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  100 
 
 		 505 aa  963    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  54.15 
 
 		 477 aa  473  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  53.27 
 
 		 461 aa  428  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  50.36 
 
 		 537 aa  420  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  68.33 
 
 		 491 aa  397  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  40.7 
 
 		 517 aa  349  7e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  62.55 
 
 		 434 aa  341  2e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  63.57 
 
 		 417 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  56.9 
 
 		 415 aa  332  8e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  54.04 
 
 		 408 aa  327  5e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  41.04 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  57.51 
 
 		 438 aa  323  6e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  58.74 
 
 		 407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  57.63 
 
 		 475 aa  317  2e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  51.57 
 
 		 443 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  56.7 
 
 		 439 aa  302  9e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  55.64 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  56.7 
 
 		 438 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  53.64 
 
 		 464 aa  300  6e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  48.66 
 
 		 452 aa  253  6e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  46.54 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  46.92 
 
 		 403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  46.92 
 
 		 405 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  46.15 
 
 		 407 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  49.03 
 
 		 426 aa  243  5e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  40.98 
 
 		 402 aa  230  4e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  41.73 
 
 		 413 aa  219  8.999999999999998e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  37.96 
 
 		 380 aa  173  5e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  33.33 
 
 		 640 aa  43.9  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  35.29 
 
 		 580 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>