31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0501 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  100 
 
 		 426 aa  830    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  46.78 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  47.7 
 
 		 405 aa  373  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  46.73 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  46.45 
 
 		 405 aa  367  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  47.78 
 
 		 403 aa  363  3e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.892675 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  47.93 
 
 		 402 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  47.83 
 
 		 413 aa  361  1e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  46.17 
 
 		 407 aa  330  2e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  43.65 
 
 		 438 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  56.02 
 
 		 464 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  52.43 
 
 		 517 aa  289  6e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  41.47 
 
 		 415 aa  286  4e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  50.94 
 
 		 475 aa  277  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  36.71 
 
 		 443 aa  271  1e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  37.56 
 
 		 438 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  39.56 
 
 		 417 aa  269  8.999999999999999e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  49.05 
 
 		 439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  37.96 
 
 		 434 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  38.37 
 
 		 408 aa  249  9e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  37.33 
 
 		 440 aa  247  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  49.03 
 
 		 505 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  48.85 
 
 		 461 aa  242  7.999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  48.29 
 
 		 477 aa  239  5e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  39.1 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  46.39 
 
 		 491 aa  233  6e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  47.73 
 
 		 537 aa  232  9e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0799  DNA primase  31.06 
 
 		 579 aa  49.3  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.7446  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0961  DNA primase  30.7 
 
 		 579 aa  47.4  0.0006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  24.88 
 
 		 842 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  30.06 
 
 		 617 aa  43.1  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>