33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1059 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  100 
 
 
402 aa  791    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  70.34 
 
 
413 aa  585  1e-166  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  47.32 
 
 
452 aa  381  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  47.93 
 
 
426 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  47.73 
 
 
407 aa  360  2e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  46.98 
 
 
405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  48.1 
 
 
405 aa  355  5.999999999999999e-97  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  47.34 
 
 
403 aa  353  4e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  47.72 
 
 
407 aa  322  5e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  42.49 
 
 
438 aa  306  3e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  38.76 
 
 
434 aa  271  2e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  38.83 
 
 
417 aa  268  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  39.13 
 
 
415 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  44.41 
 
 
475 aa  264  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  49.1 
 
 
517 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  52.79 
 
 
464 aa  259  6e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  39.16 
 
 
408 aa  248  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  37.67 
 
 
443 aa  247  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  44.75 
 
 
477 aa  247  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  36.67 
 
 
438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  38.6 
 
 
380 aa  243  5e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  37.36 
 
 
440 aa  243  5e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  49.62 
 
 
438 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  46.59 
 
 
461 aa  237  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  48.87 
 
 
439 aa  236  7e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  43.34 
 
 
491 aa  235  8e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  44.36 
 
 
505 aa  229  6e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  44.7 
 
 
537 aa  223  4e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0961  DNA primase  31.53 
 
 
579 aa  50.1  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  26.03 
 
 
605 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1449  DNA primase  32.11 
 
 
603 aa  44.3  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  33.33 
 
 
657 aa  43.9  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  28.23 
 
 
573 aa  43.1  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>