29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1050 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  81.62 
 
 		 403 aa  650    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  80.49 
 
 		 405 aa  654    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  100 
 
 		 407 aa  800    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  81.98 
 
 		 405 aa  649    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  52.89 
 
 		 452 aa  464  1e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  47.47 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  47.73 
 
 		 402 aa  364  2e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  45.91 
 
 		 413 aa  360  3e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  44.97 
 
 		 407 aa  328  8e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  41.84 
 
 		 438 aa  318  1e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  55.43 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  38.46 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  50.37 
 
 		 443 aa  280  4e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  39.23 
 
 		 417 aa  279  8e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  45.18 
 
 		 517 aa  279  8e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  51.46 
 
 		 438 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  52.04 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  48.89 
 
 		 475 aa  276  5e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  52.08 
 
 		 439 aa  272  9e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  39.11 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  37.35 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  36.45 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  48.29 
 
 		 461 aa  252  6e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  42.66 
 
 		 491 aa  245  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  42.27 
 
 		 477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  46.15 
 
 		 505 aa  244  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  45.59 
 
 		 537 aa  242  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  33.92 
 
 		 380 aa  212  1e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  27.35 
 
 		 656 aa  43.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>