38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1395 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  100 
 
 		 407 aa  798    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  48.36 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  47.34 
 
 		 417 aa  343  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  47.19 
 
 		 415 aa  343  2e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  46.17 
 
 		 426 aa  342  5e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  59.14 
 
 		 475 aa  340  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  52.88 
 
 		 517 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  48.61 
 
 		 402 aa  332  8e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  44.97 
 
 		 407 aa  332  1e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  46 
 
 		 408 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  55.22 
 
 		 464 aa  329  6e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  44.42 
 
 		 405 aa  327  3e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  44.7 
 
 		 403 aa  326  5e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  45.71 
 
 		 405 aa  325  6e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  58.74 
 
 		 505 aa  322  9.000000000000001e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  60.69 
 
 		 491 aa  321  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  43.76 
 
 		 443 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  60.69 
 
 		 477 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  43.19 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  56.55 
 
 		 440 aa  316  4e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  43.07 
 
 		 413 aa  312  5.999999999999999e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  59.85 
 
 		 438 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  59.09 
 
 		 438 aa  308  9e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  59.09 
 
 		 439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  51.03 
 
 		 452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  56.65 
 
 		 461 aa  298  1e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  56.06 
 
 		 537 aa  286  5e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  37.27 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_002620  TC0175  DNA primase  28.77 
 
 		 600 aa  49.7  0.00008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0761  DNA primase  42.25 
 
 		 607 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  30.28 
 
 		 653 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  27.61 
 
 		 641 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  26.56 
 
 		 584 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  30.77 
 
 		 656 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  29.32 
 
 		 588 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  27.63 
 
 		 576 aa  43.9  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  32.91 
 
 		 662 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1574  DNA primase  28.1 
 
 		 705 aa  43.1  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0270687  normal  0.0108391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>