73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1103 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  100 
 
 		 440 aa  878    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  52.73 
 
 		 415 aa  425  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  50.91 
 
 		 417 aa  413  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  51.25 
 
 		 408 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  48.55 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  46.17 
 
 		 438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  41.81 
 
 		 477 aa  317  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  49.11 
 
 		 475 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  57.91 
 
 		 407 aa  312  1e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  39.91 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  55.88 
 
 		 517 aa  310  4e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  41.29 
 
 		 438 aa  310  5e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  58.17 
 
 		 505 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  41.94 
 
 		 461 aa  306  6e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  51.93 
 
 		 464 aa  299  6e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  40.67 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  40.13 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  54.68 
 
 		 491 aa  288  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  53.31 
 
 		 537 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  48.68 
 
 		 452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  35.55 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  47.87 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  36.14 
 
 		 407 aa  249  6e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  48.21 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  37.33 
 
 		 426 aa  247  4e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  37.36 
 
 		 402 aa  243  6e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  35.08 
 
 		 413 aa  235  9e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  39.53 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf347  DNA primase  34.67 
 
 		 612 aa  49.3  0.0001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.603388  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  33.33 
 
 		 539 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  39.47 
 
 		 653 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  39.56 
 
 		 704 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  45.28 
 
 		 662 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2227  DNA primase  39.36 
 
 		 671 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.914663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  41.89 
 
 		 640 aa  47  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  44.64 
 
 		 560 aa  47.4  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  34.96 
 
 		 663 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3106  DNA primase  32 
 
 		 678 aa  47  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  31.82 
 
 		 588 aa  47.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  44.12 
 
 		 678 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  37.14 
 
 		 666 aa  46.6  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  30.48 
 
 		 576 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  42.86 
 
 		 594 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3973  DNA primase  34.62 
 
 		 685 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  35.25 
 
 		 664 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1574  DNA primase  32.23 
 
 		 705 aa  46.2  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0270687  normal  0.0108391 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  37.5 
 
 		 584 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  33.59 
 
 		 583 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  31.79 
 
 		 603 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2703  DNA primase  33.11 
 
 		 666 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  41.77 
 
 		 660 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  35.63 
 
 		 657 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  44 
 
 		 674 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0761  DNA primase  47.17 
 
 		 607 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  38.67 
 
 		 677 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  38.67 
 
 		 677 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  30 
 
 		 577 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  38.67 
 
 		 677 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  30 
 
 		 578 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2962  DNA primase  32.45 
 
 		 669 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  31.13 
 
 		 603 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  44.64 
 
 		 605 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  44.64 
 
 		 605 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  33.98 
 
 		 571 aa  43.9  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4132  DNA primase  33.33 
 
 		 683 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  32.04 
 
 		 656 aa  44.3  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  33.33 
 
 		 655 aa  43.9  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  34.44 
 
 		 535 aa  43.5  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  44.64 
 
 		 703 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  35.24 
 
 		 651 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  33.61 
 
 		 613 aa  43.5  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  30.61 
 
 		 673 aa  43.5  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  33.33 
 
 		 663 aa  43.1  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>