33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1544 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  100 
 
 
461 aa  888    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  53.96 
 
 
477 aa  455  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  51.03 
 
 
491 aa  428  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  72.6 
 
 
537 aa  392  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  69.64 
 
 
505 aa  377  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  43.57 
 
 
417 aa  341  2e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  43.64 
 
 
415 aa  338  8e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  43.07 
 
 
438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  39.62 
 
 
475 aa  326  7e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  42.98 
 
 
434 aa  324  2e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  43.86 
 
 
440 aa  318  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  41.52 
 
 
408 aa  312  1e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  51.77 
 
 
443 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  53.73 
 
 
517 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  52.6 
 
 
438 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  52.25 
 
 
438 aa  300  3e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  56.65 
 
 
407 aa  296  4e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  54.92 
 
 
439 aa  294  3e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  51.53 
 
 
464 aa  286  5e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  47.15 
 
 
405 aa  251  2e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  48.29 
 
 
407 aa  250  4e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  47.53 
 
 
405 aa  249  1e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  45.63 
 
 
403 aa  247  4e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  45.66 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  48.85 
 
 
426 aa  241  2e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  44.67 
 
 
402 aa  238  1e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  43.02 
 
 
413 aa  223  6e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  38.13 
 
 
380 aa  169  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  37.35 
 
 
657 aa  46.6  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0175  DNA primase  35.9 
 
 
600 aa  45.8  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0961  DNA primase  35.11 
 
 
579 aa  45.1  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  36.92 
 
 
535 aa  43.5  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  34.94 
 
 
573 aa  43.1  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>