31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1302 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  100 
 
 
380 aa  766    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  38.6 
 
 
402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  39.1 
 
 
426 aa  238  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  36.36 
 
 
413 aa  232  9e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  37.27 
 
 
407 aa  215  8e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  33.92 
 
 
407 aa  207  3e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  43.33 
 
 
452 aa  205  1e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  34.77 
 
 
403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  40.31 
 
 
517 aa  196  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  32.3 
 
 
438 aa  194  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  39.53 
 
 
475 aa  192  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  33.59 
 
 
405 aa  192  6e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  36.68 
 
 
434 aa  191  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  41.43 
 
 
415 aa  188  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  32.49 
 
 
405 aa  187  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  39.53 
 
 
440 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  42.92 
 
 
417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  43.08 
 
 
491 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  40.64 
 
 
408 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  36.81 
 
 
464 aa  177  3e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  42.92 
 
 
477 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  37.96 
 
 
505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  38.01 
 
 
443 aa  172  9e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  38.13 
 
 
461 aa  169  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  40.32 
 
 
537 aa  169  8e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  38.52 
 
 
438 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  38.62 
 
 
438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  37.94 
 
 
439 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1480  DNA primase  28.76 
 
 
669 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  41.67 
 
 
573 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  34.31 
 
 
605 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>