33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0959 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  100 
 
 		 517 aa  1026    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  60.97 
 
 		 475 aa  579  1e-164  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  68.95 
 
 		 438 aa  419  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  64.23 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  61.31 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  54.84 
 
 		 408 aa  342  9e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  39.24 
 
 		 477 aa  338  9.999999999999999e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  60.37 
 
 		 443 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  56.79 
 
 		 407 aa  335  1e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  57.41 
 
 		 464 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  60.9 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  53.64 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  57.14 
 
 		 434 aa  322  7e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  60.38 
 
 		 439 aa  320  3e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  56.77 
 
 		 491 aa  320  3e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  56.07 
 
 		 505 aa  320  3e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  55.88 
 
 		 440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  53.73 
 
 		 461 aa  302  9e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  49.83 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  54.78 
 
 		 537 aa  296  4e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  52.43 
 
 		 426 aa  289  1e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  48.89 
 
 		 403 aa  276  5e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  48.89 
 
 		 405 aa  276  8e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  46.48 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  47.04 
 
 		 405 aa  274  3e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  47.95 
 
 		 413 aa  266  5.999999999999999e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  49.1 
 
 		 402 aa  262  1e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  40.31 
 
 		 380 aa  196  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  32.43 
 
 		 573 aa  49.7  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  31.82 
 
 		 588 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  35.06 
 
 		 584 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  28.97 
 
 		 657 aa  44.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1626  DNA primase  26.71 
 
 		 647 aa  43.5  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>