31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0596 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  78.84 
 
 
438 aa  677    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  79.42 
 
 
439 aa  665    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  100 
 
 
443 aa  885    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  78.75 
 
 
438 aa  657    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  54.13 
 
 
464 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  63.16 
 
 
438 aa  354  2e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  55.05 
 
 
475 aa  340  4e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  60.37 
 
 
517 aa  336  5e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  58.55 
 
 
415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  57.51 
 
 
417 aa  325  9e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  42.25 
 
 
434 aa  320  3e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  58.43 
 
 
407 aa  319  7.999999999999999e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  39.91 
 
 
440 aa  310  4e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  53.73 
 
 
505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  53.79 
 
 
461 aa  302  1e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  53.56 
 
 
491 aa  299  6e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  52.81 
 
 
477 aa  296  7e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  52.07 
 
 
408 aa  293  5e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  48.94 
 
 
452 aa  281  2e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  49.63 
 
 
405 aa  281  2e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  50.18 
 
 
407 aa  280  4e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  49.45 
 
 
403 aa  279  9e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  50.18 
 
 
405 aa  277  2e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  49.28 
 
 
537 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  36.71 
 
 
426 aa  271  1e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  37.33 
 
 
413 aa  258  2e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  37.67 
 
 
402 aa  247  3e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  38.01 
 
 
380 aa  172  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  39.68 
 
 
584 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  25.85 
 
 
588 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  45.61 
 
 
560 aa  43.1  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>