More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1346 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.17 
 
 
531 aa  707    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.95 
 
 
565 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  64.17 
 
 
531 aa  704    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
534 aa  1104    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  64.35 
 
 
531 aa  705    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  56.03 
 
 
559 aa  619  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.68 
 
 
533 aa  597  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  54.77 
 
 
538 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  49.25 
 
 
583 aa  561  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  35.04 
 
 
556 aa  329  9e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  39.19 
 
 
550 aa  326  6e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  37.04 
 
 
532 aa  317  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  34.71 
 
 
552 aa  309  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.06 
 
 
528 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  34.8 
 
 
527 aa  300  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.46 
 
 
521 aa  299  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  34.92 
 
 
529 aa  296  5e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.35 
 
 
531 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  36.7 
 
 
525 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  36.7 
 
 
525 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  36.7 
 
 
525 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  30.51 
 
 
563 aa  292  9e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.58 
 
 
572 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.05 
 
 
518 aa  288  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  32.79 
 
 
584 aa  286  8e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  31.29 
 
 
554 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.37 
 
 
568 aa  278  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  34.72 
 
 
527 aa  279  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  35.39 
 
 
545 aa  278  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  35.58 
 
 
521 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.95 
 
 
557 aa  273  8.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  37.39 
 
 
540 aa  272  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.77 
 
 
534 aa  270  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.41 
 
 
524 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  34.62 
 
 
520 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.29 
 
 
564 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.44 
 
 
579 aa  237  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  30 
 
 
586 aa  234  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.4 
 
 
535 aa  220  6e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.03 
 
 
536 aa  209  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  29.07 
 
 
531 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  29.59 
 
 
532 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  32.23 
 
 
527 aa  208  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  30.4 
 
 
546 aa  206  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  29.96 
 
 
532 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  29.04 
 
 
534 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  29.76 
 
 
534 aa  193  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  29.11 
 
 
502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  30.09 
 
 
467 aa  182  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  25.87 
 
 
554 aa  177  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.42 
 
 
510 aa  177  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.01 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  27.6 
 
 
470 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  26.09 
 
 
517 aa  163  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.41 
 
 
520 aa  161  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.09 
 
 
516 aa  160  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  26.65 
 
 
520 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.42 
 
 
523 aa  158  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  28.73 
 
 
484 aa  157  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  25.51 
 
 
465 aa  155  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  27.49 
 
 
484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.49 
 
 
484 aa  154  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  27.49 
 
 
484 aa  154  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  27.05 
 
 
484 aa  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  27.27 
 
 
484 aa  153  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  27.27 
 
 
484 aa  153  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  27.27 
 
 
484 aa  153  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  27.27 
 
 
484 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  25.17 
 
 
513 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  27.95 
 
 
469 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.39 
 
 
457 aa  126  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  27.51 
 
 
469 aa  124  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.51 
 
 
469 aa  124  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.51 
 
 
469 aa  124  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.51 
 
 
469 aa  124  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  27.51 
 
 
469 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  27.51 
 
 
469 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  27.51 
 
 
469 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.22 
 
 
474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  25.77 
 
 
471 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  24.54 
 
 
462 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  25.54 
 
 
469 aa  120  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  25.67 
 
 
471 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.75 
 
 
469 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  25.54 
 
 
452 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.54 
 
 
469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  31.76 
 
 
572 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  24.59 
 
 
472 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 
485 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  24.59 
 
 
472 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  25.2 
 
 
472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.32 
 
 
469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1997  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.34 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.11 
 
 
469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.39 
 
 
470 aa  114  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.49 
 
 
469 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3935  FAD linked oxidase domain protein  24.43 
 
 
465 aa  114  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  25.39 
 
 
495 aa  113  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  26 
 
 
499 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.28 
 
 
464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>