134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1088 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  100 
 
 		 300 aa  578  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  67.8 
 
 		 312 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  60.9 
 
 		 294 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  61.94 
 
 		 294 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  63.07 
 
 		 294 aa  326  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  60.9 
 
 		 294 aa  326  3e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  61.32 
 
 		 292 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  56.71 
 
 		 299 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  60.98 
 
 		 292 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  59 
 
 		 298 aa  316  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  60.98 
 
 		 292 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  58.33 
 
 		 298 aa  309  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  58.67 
 
 		 298 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  58.67 
 
 		 298 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  58.67 
 
 		 298 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  59.33 
 
 		 298 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  57.43 
 
 		 296 aa  305  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  58.84 
 
 		 294 aa  305  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  58.59 
 
 		 302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  57.34 
 
 		 298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  57.43 
 
 		 296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  60.07 
 
 		 339 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  57.48 
 
 		 295 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  56.81 
 
 		 313 aa  302  6.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  57.33 
 
 		 302 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  57.53 
 
 		 295 aa  299  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  58.16 
 
 		 293 aa  296  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  58.02 
 
 		 303 aa  295  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  55.44 
 
 		 317 aa  295  7e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  57.76 
 
 		 336 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  57.95 
 
 		 298 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  57.95 
 
 		 298 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  57.95 
 
 		 298 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  57.95 
 
 		 298 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  57.95 
 
 		 298 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  57.95 
 
 		 298 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  55.29 
 
 		 311 aa  291  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  55.9 
 
 		 315 aa  291  8e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  57.38 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  56.48 
 
 		 299 aa  285  9e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  56.15 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  58.82 
 
 		 296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  55.56 
 
 		 295 aa  281  9e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  54 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  52.28 
 
 		 297 aa  262  4.999999999999999e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  47.12 
 
 		 325 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  49.28 
 
 		 306 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  53.1 
 
 		 329 aa  239  5e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  47.18 
 
 		 309 aa  237  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  49.65 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  46.18 
 
 		 304 aa  225  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  48.64 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  48.99 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  48.8 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  45.21 
 
 		 305 aa  209  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  44.2 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  45.66 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  41.08 
 
 		 298 aa  202  8e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  46.72 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  44.09 
 
 		 640 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.49 
 
 		 299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  40.28 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  41.46 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  40.62 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  44.78 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  41.98 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  42.03 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 365 aa  172  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  42.22 
 
 		 287 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 289 aa  162  7e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.89 
 
 		 584 aa  160  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  41.76 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  33.72 
 
 		 363 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  59.79 
 
 		 120 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3057  inner-membrane translocator  29.3 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  28.32 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  25.65 
 
 		 338 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1189  inner-membrane translocator  25.73 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.227031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0122  inner-membrane translocator  27.81 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3520  inner-membrane translocator  27.59 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5156  inner-membrane translocator  27.43 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  27.73 
 
 		 317 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0466  inner-membrane translocator  29.81 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0964978  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  26.63 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  28.7 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  40 
 
 		 548 aa  46.6  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 291 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2053  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 367 aa  46.2  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.377779  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5758  inner-membrane translocator  38.71 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.663374 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  28.25 
 
 		 311 aa  46.2  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0968  inner-membrane translocator  28.1 
 
 		 345 aa  46.2  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2116  monosaccharide-transporting ATPase  25.99 
 
 		 340 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.326273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  28.25 
 
 		 311 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  28.25 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  28.25 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>