65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2053 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2053  inner-membrane translocator  100 
 
 		 367 aa  722    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.377779  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0122  inner-membrane translocator  44.97 
 
 		 348 aa  306  3e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0050  inner-membrane translocator  45.21 
 
 		 347 aa  280  4e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.617843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2828  inner-membrane translocator  42.73 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0415  ABC transporter integral membrane protein  40.35 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0049  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 354 aa  135  9e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.562549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2829  inner-membrane translocator  27.05 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0123  inner-membrane translocator  30.11 
 
 		 367 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0416  ABC transporter integral membrane protein  28.53 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2052  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 489 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0827498  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.93 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.33 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  29.05 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  29.5 
 
 		 640 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  27.52 
 
 		 292 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  26.62 
 
 		 313 aa  52.8  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  28.87 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  28.87 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 300 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  29.58 
 
 		 298 aa  50.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  25.43 
 
 		 307 aa  49.7  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  29.58 
 
 		 298 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  28.67 
 
 		 305 aa  49.7  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  27.01 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 294 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  29.58 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  28.92 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 		 339 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  28.87 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  28.87 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  28.87 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  27.33 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  27.21 
 
 		 303 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  30.97 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.34 
 
 		 299 aa  47  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  31.88 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  31.43 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  24.24 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  27.42 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  24.24 
 
 		 296 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  31.5 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  26.99 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  27.5 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  26.21 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  26.88 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  24.06 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0563  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  27.27 
 
 		 332 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000316396  normal  0.689961 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  26.97 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.93 
 
 		 364 aa  43.9  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  29.66 
 
 		 324 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 426 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  23.75 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  33.79 
 
 		 332 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  29.03 
 
 		 302 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  29.03 
 
 		 302 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  42.59 
 
 		 299 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5353  inner-membrane translocator  22.34 
 
 		 359 aa  42.7  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>