13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0050 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0050  inner-membrane translocator  100 
 
 
347 aa  681    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.617843  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0122  inner-membrane translocator  47.8 
 
 
348 aa  347  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2828  inner-membrane translocator  46.84 
 
 
328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2053  inner-membrane translocator  45.21 
 
 
367 aa  275  9e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.377779  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0415  ABC transporter integral membrane protein  42.94 
 
 
343 aa  264  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2829  inner-membrane translocator  29.63 
 
 
358 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0123  inner-membrane translocator  27.54 
 
 
367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0416  ABC transporter integral membrane protein  31.66 
 
 
338 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0049  inner-membrane translocator  28.18 
 
 
354 aa  120  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.562549  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2052  inner-membrane translocator  30.77 
 
 
489 aa  60.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0827498  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0783  monosaccharide-transporting ATPase  27.71 
 
 
345 aa  46.2  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  38.46 
 
 
318 aa  43.9  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  28.21 
 
 
571 aa  43.5  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>