203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0122 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0122  inner-membrane translocator  100 
 
 
348 aa  691    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0050  inner-membrane translocator  47.8 
 
 
347 aa  333  3e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.617843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2828  inner-membrane translocator  46.67 
 
 
328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2053  inner-membrane translocator  44.97 
 
 
367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.377779  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0415  ABC transporter integral membrane protein  38.65 
 
 
343 aa  246  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0123  inner-membrane translocator  33.24 
 
 
367 aa  161  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0049  inner-membrane translocator  32.7 
 
 
354 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.562549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2829  inner-membrane translocator  27.3 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0416  ABC transporter integral membrane protein  28.7 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2052  inner-membrane translocator  30.19 
 
 
489 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0827498  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.73 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  28.57 
 
 
294 aa  60.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.64 
 
 
294 aa  60.1  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  29.17 
 
 
334 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  32.41 
 
 
313 aa  57  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  27.11 
 
 
327 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  36.73 
 
 
305 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  36.73 
 
 
305 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  36.73 
 
 
306 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  28.67 
 
 
405 aa  53.5  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  30.08 
 
 
342 aa  53.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  26.28 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3703  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.46 
 
 
415 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  29.41 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0886  inner-membrane translocator  29.47 
 
 
331 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689512  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3438  inner-membrane translocator  29.46 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0468328  normal  0.179014 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  33.68 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24370  ABC-type xylose transport system, permease component  30.48 
 
 
472 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  34.48 
 
 
291 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  28.03 
 
 
317 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  26.88 
 
 
292 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.35 
 
 
299 aa  50.4  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4770  inner-membrane translocator  23.87 
 
 
322 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626172  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  29.32 
 
 
306 aa  50.8  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4262  monosaccharide-transporting ATPase  25.62 
 
 
336 aa  50.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638371  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  25.11 
 
 
333 aa  49.3  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  29.41 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  26.69 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  28.11 
 
 
355 aa  49.3  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  28.78 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  27.81 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  38.98 
 
 
309 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  34.78 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4591  Monosaccharide-transporting ATPase  25.67 
 
 
419 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.657474  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6739  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  32.99 
 
 
415 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.29906 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3408  Monosaccharide-transporting ATPase  26.09 
 
 
334 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1703  inner-membrane translocator  44.44 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.209292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3706  inner-membrane translocator  25.5 
 
 
334 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637678  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.45 
 
 
389 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6323  inner-membrane translocator  29.46 
 
 
419 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47689  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0783  monosaccharide-transporting ATPase  26.46 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  25.29 
 
 
292 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  28.37 
 
 
322 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1124  inner-membrane translocator  26.95 
 
 
417 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0301611  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  42.59 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4655  inner-membrane translocator  22.96 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409858 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  32.67 
 
 
316 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5291  inner-membrane translocator  26.38 
 
 
425 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0362789 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  25.71 
 
 
307 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3535  inner-membrane translocator  28.99 
 
 
343 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  25.93 
 
 
292 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4238  monosaccharide-transporting ATPase  33 
 
 
420 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0284678  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4865  inner-membrane translocator  30.16 
 
 
333 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3938  ABC transporter related protein  26.83 
 
 
839 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.649029  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4476  inner-membrane translocator  41.38 
 
 
308 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4300  monosaccharide-transporting ATPase  35.92 
 
 
341 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.94979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3848  inner-membrane translocator  30.15 
 
 
420 aa  47  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  22.3 
 
 
322 aa  47  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  28.06 
 
 
351 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  29.63 
 
 
351 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  42.37 
 
 
319 aa  47  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  26.83 
 
 
306 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  22.3 
 
 
322 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  27.45 
 
 
411 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2272  inner-membrane translocator  31.96 
 
 
417 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.124039 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  24.02 
 
 
389 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1920  putative ABC transporter transmembrane transport protein  32.87 
 
 
417 aa  46.2  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.471458  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  24.02 
 
 
389 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.02 
 
 
389 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.02 
 
 
389 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.02 
 
 
389 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.02 
 
 
389 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  27.97 
 
 
303 aa  46.2  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3322  monosaccharide-transporting ATPase  27.5 
 
 
327 aa  46.2  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.897327  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  25.94 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  36.14 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  24.09 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1111  inner-membrane translocator  34.67 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6918  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
351 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0182781  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  25.5 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0317  inner-membrane translocator  26.48 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  31.71 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.36 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  35.23 
 
 
303 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  40 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  31.13 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  38.36 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  25.97 
 
 
334 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1573  inner-membrane translocator  28.57 
 
 
444 aa  45.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.984354  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>