154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0049 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0049  inner-membrane translocator  100 
 
 		 354 aa  693    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.562549  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0123  inner-membrane translocator  50.86 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2829  inner-membrane translocator  43.97 
 
 		 358 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0416  ABC transporter integral membrane protein  47.01 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2052  inner-membrane translocator  57.62 
 
 		 489 aa  176  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0827498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2828  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0415  ABC transporter integral membrane protein  29.94 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0122  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2053  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.377779  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0050  inner-membrane translocator  28.18 
 
 		 347 aa  119  9e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.617843  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3848  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3938  ABC transporter related protein  31.85 
 
 		 839 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2272  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.124039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24370  ABC-type xylose transport system, permease component  30.63 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0780  inner-membrane translocator  24.24 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6739  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  33.33 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.29906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4238  monosaccharide-transporting ATPase  31.53 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0284678  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1124  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 417 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0301611  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1573  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 444 aa  55.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.984354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5291  inner-membrane translocator  28.21 
 
 		 425 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1273  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4591  Monosaccharide-transporting ATPase  28.81 
 
 		 419 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.657474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  26.32 
 
 		 333 aa  53.1  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0261  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 401 aa  53.1  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183611  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6323  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 419 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5185  inner-membrane translocator  26.27 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3278  monosaccharide-transporting ATPase  26.53 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.990654  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  27.82 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 403 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2851  inner-membrane translocator  32.8 
 
 		 426 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3335  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 324 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5338  inner-membrane translocator  26.27 
 
 		 409 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.64 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2378  inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 419 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  26.06 
 
 		 300 aa  48.9  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01020  monosaccharide ABC transporter membrane protein  30.51 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2442  monosaccharide-transporting ATPase  34.31 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  29.33 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1423  inner-membrane translocator  27.73 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231921  normal  0.914235 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2037  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.249578  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  27.04 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  29.38 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1920  putative ABC transporter transmembrane transport protein  28.8 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.471458  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3703  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  26.27 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  22.02 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  31.78 
 
 		 357 aa  47.8  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  22.02 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3438  inner-membrane translocator  26.27 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0468328  normal  0.179014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  22.02 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  30.25 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  30.25 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  31.69 
 
 		 329 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0659  ribose ABC transporter, permease  32.46 
 
 		 329 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.717922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4655  inner-membrane translocator  23.4 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409858 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1130  inner-membrane translocator  27.64 
 
 		 478 aa  47  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0384073 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3535  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0663  monosaccharide-transporting ATPase  31.58 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  39.74 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3014  inner-membrane translocator  21.14 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  26.71 
 
 		 331 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  29.49 
 
 		 335 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5947  inner-membrane translocator  30.49 
 
 		 438 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3408  Monosaccharide-transporting ATPase  27.19 
 
 		 334 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3706  inner-membrane translocator  26.32 
 
 		 334 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4480  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 291 aa  46.2  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  29.49 
 
 		 335 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7376  ABC transporter membrane spanning protein (xylose)  27.72 
 
 		 419 aa  46.2  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0543  ribose ABC transporter, permease protein  29.59 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0696377  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  26.71 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  32.1 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1683  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382426  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4648  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2057  inner-membrane translocator  30.08 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0545  ribose ABC transporter, permease protein  29.59 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4262  monosaccharide-transporting ATPase  26.32 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6695  Monosaccharide-transporting ATPase  29.2 
 
 		 496 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159746  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3407  monosaccharide-transporting ATPase  30.61 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1738  inner-membrane translocator  27.39 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  34.04 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  27.59 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2752  inner-membrane translocator  26.95 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1034  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1602  monosaccharide-transporting ATPase  28 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6153  putative sugar (D-ribose) ABC transporter (permease protein)  32.74 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302117 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  30.51 
 
 		 350 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2978  putative ribose ABC transporter, permease protein  28.03 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1122  Monosaccharide-transporting ATPase  30.51 
 
 		 332 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  29.63 
 
 		 318 aa  44.7  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1188  inner-membrane translocator  27.66 
 
 		 449 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.559412  normal  0.103059 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf823  sugar ABC transporter permease protein  35.94 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>