148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0123 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0123  inner-membrane translocator  100 
 
 		 367 aa  734    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0049  inner-membrane translocator  50.86 
 
 		 354 aa  365  1e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.562549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2829  inner-membrane translocator  44.13 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0416  ABC transporter integral membrane protein  42.39 
 
 		 338 aa  292  6e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2052  inner-membrane translocator  53.25 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0827498  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0122  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0415  ABC transporter integral membrane protein  35.37 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2828  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0050  inner-membrane translocator  29.22 
 
 		 347 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.617843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2053  inner-membrane translocator  29.56 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.377779  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0780  inner-membrane translocator  24.2 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0592  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.23 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242667  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5338  inner-membrane translocator  24.74 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1206  inner-membrane translocator  28.68 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00220117  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2241  monosaccharide-transporting ATPase  28.29 
 
 		 360 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24370  ABC-type xylose transport system, permease component  28.46 
 
 		 472 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  33.33 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0108  inner-membrane translocator  27.59 
 
 		 493 aa  50.4  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0101  inner-membrane translocator  30.93 
 
 		 342 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.832216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  31.36 
 
 		 333 aa  50.4  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3535  inner-membrane translocator  29.65 
 
 		 343 aa  50.4  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  27.62 
 
 		 327 aa  50.4  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  33.33 
 
 		 344 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  23.14 
 
 		 332 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  23.25 
 
 		 334 aa  49.7  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1683  inner-membrane translocator  30.25 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3278  monosaccharide-transporting ATPase  28.68 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.990654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  26.85 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  24.01 
 
 		 314 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  35.65 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02438  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  27.5 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1122  Monosaccharide-transporting ATPase  27.5 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  32.35 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02402  hypothetical protein  27.5 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  27.5 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2831  putative sugar ABC transporter, permease protein  27.5 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  30.63 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1573  inner-membrane translocator  22.62 
 
 		 444 aa  47.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.984354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  26.26 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1124  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0301611  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2641  inner-membrane translocator  27.17 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2037  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.249578  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 293 aa  47.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1920  putative ABC transporter transmembrane transport protein  24.86 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.471458  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2272  inner-membrane translocator  32.56 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.124039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3938  ABC transporter related protein  26.72 
 
 		 839 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  24.16 
 
 		 332 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  26.67 
 
 		 332 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3779  putative sugar ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 		 332 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  23.91 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1607  inner-membrane translocator  26.34 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.963259  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0799  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  29.37 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2721  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0352  inner-membrane translocator  27.27 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4400  inner-membrane translocator  35 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  23.91 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1738  inner-membrane translocator  28.17 
 
 		 337 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  28.95 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0506  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  29.2 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3057  inner-membrane translocator  25.94 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0110  inner-membrane translocator  28.35 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  27.46 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2031  inner-membrane translocator  30.17 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9126  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  32.43 
 
 		 350 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.364667  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  25.13 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5317  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  22.67 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  25.58 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  25.13 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4366  Monosaccharide-transporting ATPase  27.34 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0733  inner-membrane translocator  32.5 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.73446 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  24.29 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3848  inner-membrane translocator  30.93 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  24.03 
 
 		 304 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  31.31 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.446123 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  25.9 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  30.28 
 
 		 308 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  25.9 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  27.4 
 
 		 338 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0659  ribose ABC transporter, permease  27.93 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.717922  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  26.38 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1779  inner-membrane translocator  28.85 
 
 		 305 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  26.62 
 
 		 291 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  24.75 
 
 		 333 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3595  inner-membrane translocator  27.54 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4648  inner-membrane translocator  28.3 
 
 		 310 aa  44.3  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  42.62 
 
 		 310 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>