42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2052 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2052  inner-membrane translocator  100 
 
 		 489 aa  961    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0827498  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0123  inner-membrane translocator  53.25 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0049  inner-membrane translocator  57.62 
 
 		 354 aa  176  7e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.562549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2829  inner-membrane translocator  43.4 
 
 		 358 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0416  ABC transporter integral membrane protein  43.12 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2053  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.377779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2828  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0122  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0415  ABC transporter integral membrane protein  31.29 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0050  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.617843  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 319 aa  57  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  32.5 
 
 		 319 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  29.75 
 
 		 319 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  29.75 
 
 		 319 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  34.27 
 
 		 319 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  34.27 
 
 		 319 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  34.27 
 
 		 319 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  34.27 
 
 		 319 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  35.16 
 
 		 344 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  33.33 
 
 		 319 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6323  inner-membrane translocator  26.92 
 
 		 419 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4591  Monosaccharide-transporting ATPase  29.69 
 
 		 419 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.657474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  37.17 
 
 		 317 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  30.17 
 
 		 317 aa  47.4  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  36.21 
 
 		 317 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  30.17 
 
 		 317 aa  47.4  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 316 aa  47.4  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2404  inner-membrane translocator  34 
 
 		 315 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.72307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3681  inner-membrane translocator  29.52 
 
 		 305 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.911027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3408  Monosaccharide-transporting ATPase  30.97 
 
 		 334 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  32 
 
 		 403 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1573  inner-membrane translocator  29.06 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.984354  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0780  inner-membrane translocator  25.62 
 
 		 328 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 319 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3706  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 334 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  26.67 
 
 		 300 aa  43.9  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4262  monosaccharide-transporting ATPase  30.97 
 
 		 336 aa  43.5  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0506  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 339 aa  43.5  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4770  inner-membrane translocator  27.73 
 
 		 322 aa  43.5  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 291 aa  43.5  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>