More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2562 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2562  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
578 aa  1196    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  30.75 
 
 
1239 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
1264 aa  111  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  34.73 
 
 
756 aa  91.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
378 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0310  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.48 
 
 
643 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0259  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
643 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0325  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.94 
 
 
643 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347044  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  23.81 
 
 
745 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0305  hypothetical protein  30.49 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0340  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.06 
 
 
643 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
703 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
367 aa  64.3  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
384 aa  63.9  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
1080 aa  62  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  23.14 
 
 
380 aa  62  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5864  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
394 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  26.35 
 
 
371 aa  59.7  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  23.82 
 
 
380 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 
382 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
380 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0292  glycosyl transferase, group 1  34.4 
 
 
365 aa  57.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1285  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
389 aa  58.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.104889  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2859  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 
354 aa  57.4  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.52 
 
 
381 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0295  phosphatidylinositol glycan-class A  21.52 
 
 
345 aa  56.6  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2479  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 
380 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0145757  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
395 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  22.81 
 
 
374 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  28.21 
 
 
430 aa  55.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4031  glycosyl transferase, group 1  22.36 
 
 
387 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.317277  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.21 
 
 
427 aa  55.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
389 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37583  predicted protein  26.16 
 
 
400 aa  55.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17568  hitchhiker  0.00128126 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0265  hypothetical protein  29.6 
 
 
144 aa  55.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27880  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  28.39 
 
 
1269 aa  55.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.893451  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3441  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
396 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  36.28 
 
 
378 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
658 aa  55.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
370 aa  54.7  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
379 aa  54.7  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.63 
 
 
381 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 
382 aa  54.7  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 
378 aa  54.7  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  23.51 
 
 
401 aa  54.3  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 
419 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
378 aa  54.3  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  22.38 
 
 
377 aa  54.3  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 
419 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
386 aa  54.3  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 
369 aa  53.9  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 
399 aa  54.3  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.63 
 
 
381 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.69 
 
 
381 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  22.17 
 
 
374 aa  53.9  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  21.26 
 
 
409 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0690  glycosyl transferase group 1  39.29 
 
 
385 aa  53.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.945195  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1189  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
383 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  25.18 
 
 
387 aa  53.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  21.34 
 
 
381 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  31.73 
 
 
377 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
384 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
395 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
345 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 
381 aa  52.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
457 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.76 
 
 
381 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  32.76 
 
 
381 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  32.76 
 
 
381 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
381 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
415 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  32.76 
 
 
381 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
426 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.76 
 
 
381 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0317  glycosyl transferase family protein  22.6 
 
 
329 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0399103  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  22.15 
 
 
384 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  23.56 
 
 
394 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
369 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  22.13 
 
 
426 aa  52  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  22.87 
 
 
446 aa  52  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  24.52 
 
 
382 aa  52  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 
373 aa  52  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
381 aa  52  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
704 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 
359 aa  51.6  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1808  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
397 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  29.03 
 
 
379 aa  51.6  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
371 aa  51.6  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 
387 aa  51.6  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
404 aa  51.6  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  22.17 
 
 
379 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  21.34 
 
 
374 aa  51.6  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
381 aa  51.6  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1131  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
357 aa  51.2  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
365 aa  51.2  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
377 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4741  glycosyl transferase group 1  22.61 
 
 
409 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.506008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0060  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 
656 aa  50.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19162  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
377 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
398 aa  50.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>