170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2208 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  392  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  58.17 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  55.08 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  55.08 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  53.59 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  55.29 
 
 		 219 aa  201  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1465  peptidase M50  53.23 
 
 		 219 aa  195  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.658602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1788  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  53.23 
 
 		 219 aa  195  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  52.13 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1526  putative integral membrane transmembrane protein  54.21 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0750535 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  51.66 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000010669  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  50.79 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1037  peptidase M50  59.04 
 
 		 233 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.489327  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  50.26 
 
 		 239 aa  181  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1875  peptidase M50  52.88 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2316  peptidase M50  54.19 
 
 		 216 aa  178  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  50.52 
 
 		 222 aa  178  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  49.03 
 
 		 220 aa  174  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  47.32 
 
 		 222 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  47.57 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  47.76 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  47.76 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  47.76 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  48.44 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  52 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  52 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1339  peptidase M50  47.89 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000024793 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  47.09 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  46.77 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  47.09 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  47.09 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  47.32 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  47.09 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  47.09 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1582  peptidase M50  49.51 
 
 		 220 aa  168  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453611  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  47.06 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2551  peptidase M50  49.02 
 
 		 220 aa  167  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00369558  normal  0.148044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3239  peptidase M50  44.44 
 
 		 222 aa  167  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  49.21 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  45.64 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  49.21 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  0.0000725285 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  46.11 
 
 		 221 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  48.98 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267002 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  45.6 
 
 		 221 aa  161  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  48.97 
 
 		 247 aa  161  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  46.34 
 
 		 260 aa  161  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1002  peptidase M50  44.33 
 
 		 222 aa  161  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693021  hitchhiker  0.000264691 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  51.41 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  42.86 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2460  peptidase M50  54.68 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.754633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  46.94 
 
 		 214 aa  152  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  46.6 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  44.85 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  50.82 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1686  peptidase M50  47.67 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156673  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1624  peptidase M50  45.13 
 
 		 227 aa  150  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  44.39 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  45.41 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0681  peptidase M50  48.7 
 
 		 221 aa  149  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.259408  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  42.93 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  44.9 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  45.41 
 
 		 226 aa  148  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  50.87 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1142  integral membrane transmembrane protein  46.88 
 
 		 225 aa  147  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  45.1 
 
 		 224 aa  147  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  44.04 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1519  peptidase M50  51.19 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  46.24 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1271  peptidase M50  46.8 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194788  normal  0.0570245 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  41.08 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  41.85 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2756  peptidase M50  42.86 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  43.62 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  41.67 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  44.71 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3737  peptidase M50  50 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0751  peptidase M50  46.35 
 
 		 203 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3547  hypothetical protein  47.62 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1225  peptidase M50  41.53 
 
 		 226 aa  131  9e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.460426  normal  0.363921 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2118  peptidase M50  46.89 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  0.0277239 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0952  peptidase M50  46.11 
 
 		 231 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  44.39 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  40.61 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3219  peptidase M50  49.15 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  40.1 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  40.1 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2170  peptidase M50  41.28 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141859  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  37.75 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  41.76 
 
 		 224 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  41.76 
 
 		 224 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  41.76 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  41.76 
 
 		 224 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1686  peptidase M50  41.28 
 
 		 222 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1132  peptidase M50  44.97 
 
 		 246 aa  125  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  41.76 
 
 		 224 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  41.76 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  43.41 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2248  peptidase M50  49.16 
 
 		 223 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06780  Zn-dependent protease  42.86 
 
 		 228 aa  124  9e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0109989  normal  0.843659 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09610  Zn-dependent protease  43.41 
 
 		 224 aa  124  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000371518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>