More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1760 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  100 
 
 		 654 aa  1278    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2952  Sodium/hydrogen exchanger, TrkA-N  52.3 
 
 		 568 aa  513  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  46.72 
 
 		 659 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  44.53 
 
 		 674 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  43.79 
 
 		 659 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  45.8 
 
 		 659 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  42.43 
 
 		 652 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  45.8 
 
 		 659 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  42.73 
 
 		 660 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  41.27 
 
 		 666 aa  455  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  38.56 
 
 		 662 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  42.58 
 
 		 660 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  44.58 
 
 		 661 aa  450  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  38.96 
 
 		 657 aa  451  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  44.58 
 
 		 661 aa  450  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  42.61 
 
 		 668 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  42.46 
 
 		 668 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  42.46 
 
 		 668 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  42.61 
 
 		 678 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  42.46 
 
 		 668 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  39.06 
 
 		 649 aa  439  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  44.27 
 
 		 658 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  40.61 
 
 		 656 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  43.77 
 
 		 663 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  41.27 
 
 		 661 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  45.07 
 
 		 655 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  39.76 
 
 		 650 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  38.73 
 
 		 649 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  42.73 
 
 		 667 aa  425  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  43.61 
 
 		 669 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  43.61 
 
 		 669 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  43.66 
 
 		 663 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  43.61 
 
 		 669 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  43.61 
 
 		 669 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  43.61 
 
 		 669 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  43.61 
 
 		 669 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  42.3 
 
 		 670 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  42.3 
 
 		 670 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  39.39 
 
 		 648 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  39.39 
 
 		 648 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  39.39 
 
 		 648 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  39.24 
 
 		 648 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  39.66 
 
 		 648 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  39.97 
 
 		 648 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  42.09 
 
 		 666 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  40.39 
 
 		 649 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  39.39 
 
 		 649 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  39.72 
 
 		 648 aa  413  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  39.97 
 
 		 648 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  39.97 
 
 		 648 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  36.93 
 
 		 720 aa  413  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  41.78 
 
 		 667 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  39.21 
 
 		 653 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  40.9 
 
 		 661 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  38.8 
 
 		 655 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  42.37 
 
 		 665 aa  399  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.92 
 
 		 680 aa  392  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  40.84 
 
 		 661 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  44.12 
 
 		 570 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  39.45 
 
 		 661 aa  388  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  40.52 
 
 		 664 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  40.63 
 
 		 661 aa  389  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  36.01 
 
 		 654 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3491  potassium efflux system protein  41.15 
 
 		 661 aa  375  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  39.53 
 
 		 574 aa  347  4e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.67 
 
 		 579 aa  336  9e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.94 
 
 		 572 aa  332  1e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  36.52 
 
 		 629 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  35.87 
 
 		 591 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  36.92 
 
 		 583 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  31.52 
 
 		 674 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  35.16 
 
 		 593 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0885  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.4 
 
 		 578 aa  301  2e-80  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  35.23 
 
 		 583 aa  301  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  36.19 
 
 		 595 aa  297  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  36.19 
 
 		 630 aa  295  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5461  sodium/hydrogen exchanger  36.21 
 
 		 597 aa  296  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  33.9 
 
 		 568 aa  295  2e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  37.75 
 
 		 590 aa  294  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  33.71 
 
 		 569 aa  293  6e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  36.01 
 
 		 630 aa  292  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.12 
 
 		 697 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  31.45 
 
 		 664 aa  287  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  33.69 
 
 		 666 aa  287  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  37.8 
 
 		 594 aa  286  8e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  31.42 
 
 		 682 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5173  sodium/hydrogen exchanger  36.93 
 
 		 632 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  32.77 
 
 		 741 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  35.6 
 
 		 668 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 		 665 aa  282  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  32.03 
 
 		 672 aa  283  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 		 658 aa  281  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.29 
 
 		 671 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51113  CPA2 family transporter: potassium ion efflux  37.57 
 
 		 593 aa  278  3e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0882446  normal  0.0997387 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  31.18 
 
 		 636 aa  277  5e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0395  potassium efflux system protein  37.36 
 
 		 577 aa  276  6e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4369  sodium/hydrogen exchanger  36.32 
 
 		 592 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.29 
 
 		 663 aa  274  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  31.94 
 
 		 665 aa  274  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  34.05 
 
 		 666 aa  274  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>