More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf109 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf109  L-lactate dehydrogenase  100 
 
 
320 aa  647    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0268317  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0439  L-lactate/malate dehydrogenase  40.51 
 
 
317 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00200825  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl596  L-lactate dehydrogenase  38.67 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1232  L-lactate dehydrogenase  34.49 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00828905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 
314 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 
314 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 
314 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 
314 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 
314 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 
314 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  34.08 
 
 
314 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  33.76 
 
 
314 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  35.18 
 
 
314 aa  187  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  32.8 
 
 
314 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  33.01 
 
 
315 aa  183  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 
314 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 
314 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 
314 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 
314 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 
314 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 
314 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 
314 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 
314 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  33.76 
 
 
314 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  36.16 
 
 
311 aa  181  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  32.15 
 
 
314 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1232  L-lactate dehydrogenase  33.01 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  31.51 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  33.44 
 
 
314 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1455  L-lactate dehydrogenase  31.78 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2156  L-lactate dehydrogenase  32.13 
 
 
316 aa  172  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2624  L-lactate dehydrogenase  34.31 
 
 
319 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2678  L-lactate dehydrogenase  34.31 
 
 
319 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0269  L-lactate dehydrogenase  32.18 
 
 
323 aa  170  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0716  malate dehydrogenase (NAD)  32.46 
 
 
319 aa  170  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000101749  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  31.27 
 
 
319 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1505  L-lactate dehydrogenase  31.54 
 
 
322 aa  169  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  34.19 
 
 
316 aa  169  8e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  31.58 
 
 
317 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0907  malate dehydrogenase (NAD)  33.66 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.657603  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  33.22 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1257  L-lactate dehydrogenase  33.13 
 
 
328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000840632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  32.89 
 
 
316 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1272  malate dehydrogenase (NAD)  34.46 
 
 
312 aa  162  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000869025  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  32.89 
 
 
316 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  32.89 
 
 
316 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  32.89 
 
 
316 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  30.28 
 
 
318 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  32.55 
 
 
316 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0102  L-lactate dehydrogenase  32.2 
 
 
317 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.02476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  32.55 
 
 
316 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0959  L-lactate dehydrogenase  32.41 
 
 
329 aa  160  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000716339  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  31.99 
 
 
401 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0098  L-lactate dehydrogenase  32.2 
 
 
317 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  32.55 
 
 
316 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5135  L-lactate dehydrogenase  32.55 
 
 
316 aa  159  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28654  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0435  L-2-hydroxyisocaproate/malate/lactate dehydrogenase-like protein  29.49 
 
 
316 aa  156  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0223779  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0231  L-lactate dehydrogenase  30.92 
 
 
317 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0225  L-lactate dehydrogenase  30.92 
 
 
317 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  32.55 
 
 
316 aa  156  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1239  L-lactate dehydrogenase  30.72 
 
 
323 aa  155  9e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0560489  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1175  L-lactate dehydrogenase  31.94 
 
 
310 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0520  L-lactate dehydrogenase  29.61 
 
 
312 aa  152  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4103  malate dehydrogenase  34.77 
 
 
310 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0128  L-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase  31.37 
 
 
305 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000555723  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2675  L-lactate dehydrogenase  31.25 
 
 
318 aa  150  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0849  L-lactate dehydrogenase  33.66 
 
 
308 aa  149  9e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000165176  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1117  L-lactate dehydrogenase  29.64 
 
 
325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000469063  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  31.66 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0132  L-lactate dehydrogenase  30.36 
 
 
313 aa  146  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2397  L-lactate dehydrogenase  30.41 
 
 
316 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.851403  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0351  L-lactate dehydrogenase  29.62 
 
 
315 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2002  malate dehydrogenase (NAD)  31.03 
 
 
341 aa  143  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2352  L-lactate dehydrogenase  29.62 
 
 
309 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0365594  normal  0.0145977 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  29.52 
 
 
310 aa  142  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0553  malate dehydrogenase (NAD)  32.97 
 
 
304 aa  141  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.270119  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  32.39 
 
 
319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0985  L-lactate dehydrogenase  30.47 
 
 
309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0463  L-lactate dehydrogenase  28.43 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23443  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0194  malate dehydrogenase (NAD)  29.13 
 
 
310 aa  139  7.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000257978  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1203  L-lactate dehydrogenase  30.03 
 
 
313 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0694  L-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase  28.89 
 
 
315 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  31.17 
 
 
307 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1582  L-lactate dehydrogenase  28.48 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  30.16 
 
 
331 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  28.89 
 
 
317 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  29.13 
 
 
316 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05842  hypothetical protein similar to L-lactate dehydrogenase (Eurofung)  28.21 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.189736  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  29.22 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1483  malate dehydrogenase (NAD)  31.23 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1919  L-lactate dehydrogenase  29.47 
 
 
313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1325  malate dehydrogenase (NAD)  30.17 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000416686  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000852  L-lactate dehydrogenase  28.71 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125875  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  27.36 
 
 
318 aa  129  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0803  malate dehydrogenase  28.62 
 
 
304 aa  129  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0510  malate dehydrogenase (NAD)  29.49 
 
 
304 aa  129  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  28.12 
 
 
312 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  28.12 
 
 
312 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  28.12 
 
 
312 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1182  L-lactate dehydrogenase  30.52 
 
 
308 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>