237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03138 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  430  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  52.97 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  51.56 
 
 		 198 aa  206  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  50.26 
 
 		 198 aa  202  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  48.15 
 
 		 198 aa  191  7e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  47.09 
 
 		 198 aa  188  5.999999999999999e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  51.14 
 
 		 201 aa  181  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  43.85 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  41.8 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  39.89 
 
 		 219 aa  158  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  39.38 
 
 		 204 aa  154  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  41.27 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  44.51 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  41.27 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  41.27 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  42.02 
 
 		 195 aa  148  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  38.34 
 
 		 204 aa  147  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  41.53 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  38.83 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  41.58 
 
 		 205 aa  144  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  42.63 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  41.15 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  39.06 
 
 		 290 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  41.49 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  41.49 
 
 		 195 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  36.98 
 
 		 204 aa  142  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  42.55 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  42.41 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  41.05 
 
 		 200 aa  138  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  35.08 
 
 		 206 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  41.81 
 
 		 195 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  41.81 
 
 		 195 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  41.81 
 
 		 195 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  38.17 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  37.77 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  39.31 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  43.26 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  38.59 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  40.46 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  38.54 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  35.45 
 
 		 203 aa  134  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  40.96 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  40.96 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  36.46 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  40.96 
 
 		 303 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  40.96 
 
 		 303 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  40.96 
 
 		 303 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  32.67 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  35.26 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  41.72 
 
 		 195 aa  131  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  37.06 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  42.07 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  38.15 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  38.83 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  41.1 
 
 		 194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  33.16 
 
 		 242 aa  128  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  43.18 
 
 		 303 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  39.36 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  39.36 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  38.89 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  39.36 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000068448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  39.36 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  39.36 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  39.36 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  39.36 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  0.0000831038 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  34.39 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  39.36 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000121216  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  33.84 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  36.51 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  40.49 
 
 		 194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  39.36 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  39.36 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  39.36 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  37.85 
 
 		 213 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  39.89 
 
 		 204 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  39.05 
 
 		 199 aa  124  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  36.17 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  36.26 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  31.61 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  37.37 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  32.12 
 
 		 204 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  38.83 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  38.83 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  31.61 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  36.51 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  35.06 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  35.48 
 
 		 209 aa  121  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  37.22 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  37.06 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  37.71 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  38.27 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  40.8 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  37.65 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  40.86 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  37.65 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  37.65 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  37.06 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  37.5 
 
 		 225 aa  117  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>