158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_7000 on replicon NC_010373
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  100 
 
 		 583 aa  1176    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  47.29 
 
 		 571 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  47.55 
 
 		 577 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  34.2 
 
 		 997 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  32.51 
 
 		 559 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  32.81 
 
 		 562 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  32.64 
 
 		 561 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  33.86 
 
 		 570 aa  190  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  31.34 
 
 		 570 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  30.72 
 
 		 566 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  35.22 
 
 		 578 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  38.58 
 
 		 274 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  39.26 
 
 		 274 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  39.26 
 
 		 274 aa  115  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  37.37 
 
 		 285 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  37.01 
 
 		 285 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2867  porin  36.65 
 
 		 285 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  35.66 
 
 		 283 aa  104  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  36.2 
 
 		 277 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  35.89 
 
 		 279 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  35.74 
 
 		 278 aa  100  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  42.47 
 
 		 246 aa  100  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  33.73 
 
 		 288 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  34.01 
 
 		 302 aa  99  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  35.16 
 
 		 287 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  33.21 
 
 		 284 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  33.72 
 
 		 288 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  35.42 
 
 		 276 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  36.11 
 
 		 276 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  33.08 
 
 		 288 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  32.42 
 
 		 240 aa  94.7  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  32.06 
 
 		 296 aa  94  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  32.06 
 
 		 296 aa  94  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  32.05 
 
 		 240 aa  93.2  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2142  porin  39.22 
 
 		 284 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  33.46 
 
 		 453 aa  90.9  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3848  porin  31.45 
 
 		 287 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  35.47 
 
 		 290 aa  87  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  35.47 
 
 		 290 aa  87  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  35.47 
 
 		 290 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  29.55 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  34.5 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  31.94 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  32.79 
 
 		 258 aa  85.5  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  29.79 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0836  porin  35.42 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0404918  normal  0.853535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  35.54 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  35.54 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4355  porin  34.98 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.64859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3986  porin  34.98 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0565804  normal  0.846216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  32.05 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4466  porin  34.47 
 
 		 288 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  29.29 
 
 		 250 aa  83.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3546  porin  36.24 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0474  porin  32.09 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  30.86 
 
 		 237 aa  75.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  32.99 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  30.17 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  29.28 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  38.52 
 
 		 230 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000209958  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  28.89 
 
 		 255 aa  73.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  30.25 
 
 		 693 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  31.56 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  31.34 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3321  porin  31.25 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  32.38 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7845  porin  32.17 
 
 		 287 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190915  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  29.57 
 
 		 454 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.36 
 
 		 206 aa  69.7  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  31.28 
 
 		 234 aa  69.7  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  32.05 
 
 		 207 aa  70.1  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.85 
 
 		 206 aa  69.3  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  30 
 
 		 254 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2044  porin  31.34 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  30.42 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.24 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  31.08 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  28.46 
 
 		 652 aa  68.2  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  30.63 
 
 		 255 aa  67  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  29.05 
 
 		 447 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  29.83 
 
 		 232 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1624  porin  30.69 
 
 		 285 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.85 
 
 		 240 aa  65.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  29.13 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  30 
 
 		 692 aa  65.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  30.24 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4335  porin  29.81 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  29.32 
 
 		 206 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  28.44 
 
 		 661 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  29.54 
 
 		 245 aa  62.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  30.22 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  30.99 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.51 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1454  hypothetical protein  34.06 
 
 		 665 aa  60.8  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0429  putative 31 kDa outer-membrane immunogenic protein precursor  27.95 
 
 		 219 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.22814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3415  putative outer membrane protein of unknown function  31.4 
 
 		 680 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  28.03 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  28 
 
 		 207 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  39.5 
 
 		 670 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  28.79 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>