More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2868 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  100 
 
 
246 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  77.27 
 
 
242 aa  356  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  77.35 
 
 
245 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  57.99 
 
 
248 aa  222  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  58.9 
 
 
242 aa  218  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  57.53 
 
 
248 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  58.45 
 
 
242 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  58.45 
 
 
248 aa  190  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.22 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.19 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.55 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.86 
 
 
236 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.73 
 
 
243 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.03 
 
 
262 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.58 
 
 
1055 aa  104  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.03 
 
 
1314 aa  102  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.67 
 
 
238 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.91 
 
 
252 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.64 
 
 
1051 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.47 
 
 
258 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09390  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.43 
 
 
248 aa  99  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.89 
 
 
246 aa  98.6  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.74 
 
 
250 aa  98.6  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  30.36 
 
 
214 aa  97.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.3 
 
 
254 aa  96.3  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  35.51 
 
 
253 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.75 
 
 
1052 aa  94.7  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.84 
 
 
1051 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.88 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  32.82 
 
 
215 aa  92.8  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.84 
 
 
268 aa  92.4  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.85 
 
 
1125 aa  92.4  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  32.31 
 
 
456 aa  92  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.48 
 
 
240 aa  92  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1473  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.14 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.302617  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  32.31 
 
 
456 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.51 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  31.22 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  33.03 
 
 
227 aa  90.9  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.73 
 
 
1053 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.62 
 
 
250 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  31 
 
 
456 aa  89.7  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.74 
 
 
1053 aa  89.7  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.12 
 
 
243 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3420  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.18 
 
 
252 aa  89  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  31.08 
 
 
396 aa  88.6  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0524  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.71 
 
 
251 aa  88.6  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0185005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  32.14 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  35.34 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.62 
 
 
525 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.28 
 
 
1050 aa  86.7  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.69 
 
 
1053 aa  85.5  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.05 
 
 
231 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.79 
 
 
260 aa  85.5  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.3 
 
 
1088 aa  85.5  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 
244 aa  85.1  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.56 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.8 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.8 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  32.24 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.8 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  32.43 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  33 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1156  HAD family hydrolase  30.17 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0666674  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.49 
 
 
233 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.43 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  31.11 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  32.47 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  31.11 
 
 
225 aa  79  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.54 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  34.2 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  29.41 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525568  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.51 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.14 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.57 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  28 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  29.05 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  30 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  29.44 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  31.69 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.88 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  28.78 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0836  hypothetical protein  37.82 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35659  predicted protein  30.26 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.13 
 
 
254 aa  72  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  22.87 
 
 
220 aa  72  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.81 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  29.85 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  31.28 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  27.68 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  28.51 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  29.7 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.23 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  31.86 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  26.82 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.5 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  37.04 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  26.64 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  27.65 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0123656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>