More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1464 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
144 aa  286  7e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  75 
 
 
144 aa  208  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  71.23 
 
 
146 aa  207  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  70.55 
 
 
146 aa  207  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  71.92 
 
 
146 aa  204  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  71.92 
 
 
146 aa  204  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  67.81 
 
 
146 aa  196  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  67.12 
 
 
146 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  66.44 
 
 
146 aa  194  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  66.44 
 
 
146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  66.44 
 
 
146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  66.44 
 
 
146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  66.44 
 
 
146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  66.44 
 
 
146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  66.44 
 
 
146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  66.44 
 
 
146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 
146 aa  193  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  72.6 
 
 
146 aa  188  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  66.44 
 
 
146 aa  183  5e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  60.54 
 
 
147 aa  180  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 
146 aa  179  8.000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  59.59 
 
 
146 aa  173  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  65.07 
 
 
146 aa  170  5.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  59.59 
 
 
146 aa  165  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  58.9 
 
 
146 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  57.53 
 
 
146 aa  164  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 
147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 
147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  59.86 
 
 
154 aa  160  4.0000000000000004e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 
146 aa  158  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  56.85 
 
 
146 aa  157  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  57.82 
 
 
147 aa  156  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  57.53 
 
 
146 aa  155  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  55.78 
 
 
147 aa  151  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 
147 aa  151  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 
146 aa  152  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  55.17 
 
 
146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  55.17 
 
 
146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  51.39 
 
 
146 aa  149  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  51.39 
 
 
146 aa  149  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 
146 aa  147  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 
148 aa  147  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 
147 aa  147  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  55.78 
 
 
147 aa  146  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  53.79 
 
 
149 aa  147  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 
153 aa  146  7e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  54.42 
 
 
147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  52.41 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 
147 aa  144  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  52.41 
 
 
153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  52.63 
 
 
153 aa  144  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  52.08 
 
 
149 aa  140  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  56.76 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 
148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 
147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  48.98 
 
 
148 aa  134  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  51.35 
 
 
148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2985  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 
162 aa  133  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471834  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 
152 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2382  50S ribosomal protein L15  57.5 
 
 
147 aa  133  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000043437  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  51.02 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  53.74 
 
 
150 aa  131  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 
147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1112  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 
150 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  51.37 
 
 
172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19861  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 
150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129304  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17321  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 
152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 
159 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 
159 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17481  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 
152 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1633  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 
152 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  48.63 
 
 
145 aa  126  9.000000000000001e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  45.7 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  50 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  45.89 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  43.05 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 
162 aa  124  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  45.33 
 
 
162 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 
144 aa  125  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 
147 aa  124  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  46 
 
 
155 aa  123  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  52.48 
 
 
152 aa  122  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0380  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 
161 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1734  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 
161 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425604  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  45.89 
 
 
159 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  46.21 
 
 
161 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  45.03 
 
 
173 aa  121  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  48.94 
 
 
145 aa  121  3e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  45.33 
 
 
157 aa  121  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  41.06 
 
 
161 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  49.32 
 
 
153 aa  121  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2515  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 
160 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  44.52 
 
 
169 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  44.52 
 
 
169 aa  121  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  47.26 
 
 
176 aa  120  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  45.89 
 
 
169 aa  120  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16611  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.948391  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  46.62 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  45.89 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>