More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0793 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  71.94 
 
 		 509 aa  796    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 509 aa  1056    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  49.32 
 
 		 512 aa  523  1e-147  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  48.43 
 
 		 518 aa  514  1e-144  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  45.17 
 
 		 513 aa  485  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  45.17 
 
 		 513 aa  487  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  45.17 
 
 		 513 aa  485  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  44.58 
 
 		 513 aa  482  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  45.17 
 
 		 513 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  45.17 
 
 		 513 aa  484  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  45.17 
 
 		 512 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  45.17 
 
 		 513 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  44.97 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  45.17 
 
 		 513 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  41.57 
 
 		 513 aa  463  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  43.08 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  43 
 
 		 511 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  44.55 
 
 		 519 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  43.08 
 
 		 511 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  43 
 
 		 511 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  42.8 
 
 		 511 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  41.57 
 
 		 517 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  41.57 
 
 		 517 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  40.12 
 
 		 506 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  41.06 
 
 		 530 aa  415  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  41.47 
 
 		 514 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  38.54 
 
 		 502 aa  397  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  40.04 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  39.53 
 
 		 512 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  38.74 
 
 		 512 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  39.13 
 
 		 512 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  39.01 
 
 		 511 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  39.12 
 
 		 526 aa  365  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  39.84 
 
 		 524 aa  364  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  38.69 
 
 		 501 aa  360  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  36.94 
 
 		 486 aa  350  4e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  37.95 
 
 		 495 aa  342  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  35.47 
 
 		 489 aa  336  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  37.83 
 
 		 530 aa  313  4.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0164  gluconate kinase, C-terminus  44.82 
 
 		 333 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  36.77 
 
 		 513 aa  299  7e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  33.4 
 
 		 476 aa  269  8e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  33.4 
 
 		 476 aa  269  8e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  35.16 
 
 		 476 aa  264  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  29.47 
 
 		 505 aa  258  3e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  32.04 
 
 		 509 aa  244  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  29.55 
 
 		 518 aa  243  5e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  28.91 
 
 		 510 aa  239  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  30.2 
 
 		 499 aa  236  6e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  31.34 
 
 		 502 aa  236  8e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.05 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  28.83 
 
 		 492 aa  228  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  28.83 
 
 		 492 aa  228  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  30.71 
 
 		 514 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  27.45 
 
 		 538 aa  226  9e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  28.2 
 
 		 501 aa  226  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  28.69 
 
 		 511 aa  225  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  29 
 
 		 509 aa  223  7e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  32.09 
 
 		 515 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  32.09 
 
 		 515 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  32.09 
 
 		 515 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.97 
 
 		 483 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  31.34 
 
 		 512 aa  216  8e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  29.06 
 
 		 496 aa  215  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  29.69 
 
 		 515 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  31.69 
 
 		 515 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  26.55 
 
 		 503 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  27.42 
 
 		 506 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  33.26 
 
 		 514 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  31.3 
 
 		 515 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  26.79 
 
 		 497 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  31.69 
 
 		 515 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  28.8 
 
 		 496 aa  211  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  29.5 
 
 		 499 aa  210  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  27.99 
 
 		 500 aa  209  9e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  33.26 
 
 		 520 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  27.42 
 
 		 506 aa  208  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  30.2 
 
 		 511 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  29.01 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  27 
 
 		 489 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  25.41 
 
 		 505 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  27.29 
 
 		 519 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  28.32 
 
 		 490 aa  206  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  34.61 
 
 		 513 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  34.61 
 
 		 513 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  34.61 
 
 		 513 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  34.61 
 
 		 513 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  34.61 
 
 		 513 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  34.61 
 
 		 513 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  34.61 
 
 		 513 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3585  carbohydrate kinase, FGGY  28.89 
 
 		 494 aa  203  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.857357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  27.02 
 
 		 512 aa  203  7e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  29.07 
 
 		 511 aa  202  9e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  28.02 
 
 		 496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  28.97 
 
 		 506 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  32.66 
 
 		 517 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  32.44 
 
 		 517 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  32.58 
 
 		 511 aa  200  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  27.77 
 
 		 509 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  29.45 
 
 		 504 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>