More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0001 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 		 440 aa  906    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0001  chromosomal replication initiation protein  52.88 
 
 		 464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000013935  decreased coverage  1.67388e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  50.33 
 
 		 450 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  50.67 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  49.21 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  49.1 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  50 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  49.55 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  50 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  50 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  50 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.87 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  50 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  49.1 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  50 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  50 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  47.64 
 
 		 451 aa  421  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  48.13 
 
 		 446 aa  421  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  47.15 
 
 		 457 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  47.15 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  48.12 
 
 		 453 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  48.12 
 
 		 453 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.61 
 
 		 454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  47.81 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0001  chromosomal replication initiation protein  48.34 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.31 
 
 		 444 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  46.56 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  47.58 
 
 		 436 aa  393  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.63 
 
 		 449 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  44.55 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.49 
 
 		 463 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.31 
 
 		 456 aa  387  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.72 
 
 		 446 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  48.05 
 
 		 445 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0001  chromosomal replication initiation protein  44.86 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.817172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  46.03 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  42.92 
 
 		 445 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.02 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  41.5 
 
 		 449 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  43.14 
 
 		 450 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0001  chromosomal replication initiation protein  43.54 
 
 		 454 aa  368  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  43.17 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  43.3 
 
 		 452 aa  364  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  53.13 
 
 		 472 aa  364  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  40.35 
 
 		 458 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  40.17 
 
 		 460 aa  363  4e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.98 
 
 		 439 aa  361  1e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.69 
 
 		 453 aa  360  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  43.56 
 
 		 460 aa  360  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  41.79 
 
 		 482 aa  359  5e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  40.55 
 
 		 478 aa  359  5e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.29 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.39 
 
 		 475 aa  355  7.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.202829  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.57 
 
 		 450 aa  355  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.99 
 
 		 450 aa  355  1e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.98 
 
 		 480 aa  354  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.18 
 
 		 439 aa  352  7e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  41.89 
 
 		 451 aa  352  8.999999999999999e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.8 
 
 		 464 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  40.74 
 
 		 460 aa  350  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.59 
 
 		 457 aa  350  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  40.74 
 
 		 460 aa  350  4e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  40.74 
 
 		 460 aa  349  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.13 
 
 		 454 aa  349  5e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  42.83 
 
 		 456 aa  349  5e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  48.31 
 
 		 461 aa  349  6e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.7 
 
 		 474 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0537995  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0886  chromosomal replication initiation protein  42.29 
 
 		 462 aa  348  1e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  41.77 
 
 		 463 aa  348  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  41.39 
 
 		 449 aa  348  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  40.52 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.21 
 
 		 462 aa  348  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  47.74 
 
 		 462 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  47.74 
 
 		 462 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  41.42 
 
 		 465 aa  347  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  47.74 
 
 		 462 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  40.31 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  43.61 
 
 		 453 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  47.74 
 
 		 462 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05911  chromosomal replication initiation protein  41.52 
 
 		 464 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.37 
 
 		 442 aa  346  4e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  41.29 
 
 		 452 aa  347  4e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  41.29 
 
 		 452 aa  347  4e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  47.88 
 
 		 459 aa  346  4e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  47.85 
 
 		 462 aa  346  4e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  42.76 
 
 		 451 aa  346  5e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  42.76 
 
 		 451 aa  346  5e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0565  chromosomal replication initiation protein  41.83 
 
 		 464 aa  346  6e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  48.16 
 
 		 472 aa  345  6e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.87 
 
 		 476 aa  346  6e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000240109  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  49.7 
 
 		 457 aa  346  6e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.92 
 
 		 587 aa  345  7e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  39.74 
 
 		 454 aa  345  7e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.55 
 
 		 447 aa  345  7e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  49.4 
 
 		 468 aa  345  7e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  41.65 
 
 		 462 aa  345  8e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  48.13 
 
 		 468 aa  345  8e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  41.65 
 
 		 462 aa  345  8e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  40.56 
 
 		 461 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  42.58 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>