More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3678 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  73.22 
 
 		 576 aa  820    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3826  ABC transporter related  72.74 
 
 		 576 aa  789    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3678  ABC transporter  100 
 
 		 575 aa  1154    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  60 
 
 		 603 aa  629  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  55.6 
 
 		 570 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  49.81 
 
 		 534 aa  544  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0424  ABC transporter  48.01 
 
 		 640 aa  521  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  47.61 
 
 		 567 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  45.18 
 
 		 667 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  43.31 
 
 		 663 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  43.31 
 
 		 663 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5213  ABC transporter domain protein  40.04 
 
 		 563 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149652 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  40.9 
 
 		 665 aa  412  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22803  predicted protein  40.1 
 
 		 608 aa  399  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  38.34 
 
 		 589 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00761  ABC transporter, ATP binding protein  38.11 
 
 		 660 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00741  ABC transporter, ATP binding protein  37.09 
 
 		 660 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00771  ABC transporter, ATP binding protein  37.45 
 
 		 660 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1617  ABC transporter-like  41.09 
 
 		 669 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.477524  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00731  ABC transporter, ATP binding protein  36.74 
 
 		 662 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.862442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1622  ABC transporter-like  37.29 
 
 		 611 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0184099  normal  0.0800311 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  38.88 
 
 		 668 aa  374  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2266  ATPase  39.02 
 
 		 658 aa  372  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0067  ABC transporter ATP-binding protein  38.11 
 
 		 660 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03151  ABC transporter, ATP binding protein  37.87 
 
 		 667 aa  362  9e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1428  ABC transporter ATP-binding protein  37.16 
 
 		 662 aa  360  5e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25331  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01291  ABC transporter, ATP binding protein  36.98 
 
 		 662 aa  359  8e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  36.99 
 
 		 595 aa  340  5e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  36.24 
 
 		 610 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.83 
 
 		 587 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  36.83 
 
 		 587 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  37.7 
 
 		 605 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  38.1 
 
 		 602 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  37.54 
 
 		 615 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  37.37 
 
 		 626 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  35.63 
 
 		 621 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  35.01 
 
 		 613 aa  316  6e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  35.09 
 
 		 578 aa  314  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  33.39 
 
 		 590 aa  313  4.999999999999999e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  34.95 
 
 		 596 aa  313  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  35.31 
 
 		 593 aa  313  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  36.57 
 
 		 606 aa  312  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  33.96 
 
 		 614 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1675  ABC transporter, permease protein  34.87 
 
 		 571 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0722052  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  34.88 
 
 		 575 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.96 
 
 		 588 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  33.96 
 
 		 588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  33.96 
 
 		 588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.96 
 
 		 588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 		 588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  33.96 
 
 		 588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.96 
 
 		 588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  36.88 
 
 		 614 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  36.88 
 
 		 614 aa  304  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  35.55 
 
 		 596 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.96 
 
 		 584 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  36.33 
 
 		 588 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  35.38 
 
 		 636 aa  303  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  33.68 
 
 		 586 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  33.21 
 
 		 589 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  33.39 
 
 		 589 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  33.51 
 
 		 589 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  35.54 
 
 		 606 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  32.73 
 
 		 577 aa  301  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  33.22 
 
 		 589 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  33.22 
 
 		 589 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.03 
 
 		 589 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  33.81 
 
 		 579 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  36.52 
 
 		 614 aa  296  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  35.04 
 
 		 595 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  33.51 
 
 		 583 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.39 
 
 		 592 aa  290  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  31.79 
 
 		 630 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  34.49 
 
 		 597 aa  286  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  33.62 
 
 		 712 aa  286  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  32.74 
 
 		 588 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  32.98 
 
 		 583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.46 
 
 		 598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.39 
 
 		 599 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  32.55 
 
 		 589 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  32.6 
 
 		 713 aa  283  9e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  33.44 
 
 		 634 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  33.44 
 
 		 636 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  35.82 
 
 		 639 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  33.44 
 
 		 636 aa  281  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  32.64 
 
 		 701 aa  276  9e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  32.95 
 
 		 635 aa  270  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  31.96 
 
 		 704 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  32.54 
 
 		 712 aa  268  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  33.92 
 
 		 600 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  32.99 
 
 		 704 aa  267  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  31.9 
 
 		 708 aa  263  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 		 577 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  33.81 
 
 		 563 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  33.09 
 
 		 637 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  34.65 
 
 		 557 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  33.39 
 
 		 572 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  31.73 
 
 		 660 aa  246  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  33.69 
 
 		 557 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  31.34 
 
 		 591 aa  243  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>